Amoksisilin digunakan untuk mengobati infeksi yang disebabkan oleh bakteri tertentu, seperti pneumonia, bronkitis, gonore, dan infeksi pada telinga, hidung, tenggorokan, saluran kemih, dan kulit. Obat ini juga digunakan dalam kombinasi dengan obat-obatan lainnya untuk menghilangkan H. pylori, bakteri yang menyebabkan bisul. Amoksisilin adalah kelas obat yang disebut antibiotik seperti penisilin. Obat ini bekerja dengan cara menghentikan pertumbuhan bakteri. Antibiotik tidak akan bekerja untuk pilek, flu, dan infeksi virus lainnya.

Amoksisilin termasuk antibiotik spektrum luas dalam kelompok penisilin. Selain amoksisilin, yang termasuk dalam kelompok ini antara lain adalah ampicillin, oxacillin, carbenicillin dan piperacillin.Semua penisilin bekerja dengan mekanisme yang serupa. Zat aktif dalam amoksisilin, beta-laktam, mencegah sintesis dinding sel bakteri dengan menghambat enzim DD-transpeptidase bakteri. Akibatnya, bakteri tidak dapat berkembang biak.Amoksisilin memiliki beberapa efek samping cukup ringan, namun meningkat menurut dosis dan lama penggunaan. Kebanyakan reaksi yang merugikan disebabkan oleh fakta bahwa amoksisilin tidak hanya membunuh bakteri patogen tetapi juga bakteri baik yang merupakan flora alami usus.Efek samping potensialnya meliputi mual dan muntah, sakit perut, diare,gangguan pencernaan (dispepsia),dubur gatal dan reaksi alergi. Amoksisilin dapat berinteraksi dengan obat lain, sepertiaspirin, indometasin, sulfinpyrazone, allopurinol, probenesid, antibiotikaminoglikosida,fenilbutazon,oxyphenbutazone dan pil KB (ada kemungkinan mengurangi efektivitas pil ini).Juwita S, Hartoyo E, Budiarti LY. 2012. Pola Sensitivitas In Vitro Salmonella Typhi Terhadap Antibiotik Kloramfenikol, Amoksisilin, Dan Kotrimoksazol. Banjarmasin: Lambung Mangkurat University press.