RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER

BIOSISTEMATIKA (MAB60004)

Disusun oleh:

Tim Dosen Pengampu Biosistematika

JURUSAN BIOLOGI FMIPA UNIVERSITAS BRAWIJAYA

2020

UNIVERSITAS BRAWIJAYA

FAKULTAS MIPA JURUSAN BIOLOGI / PROGRAM STUDI SARJANA BIOLOGI

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER MATA KULIAH KODE LINGKUP KOMPETENSI BOBOT (sks) SEMESTER Tgl. Penyusunan

Biosistematika MAB60004 Ilmu Dasar Biologi 2 (2/0) II 17 Januari 2020

OTORISASI:

Dosen Pengembang RPS Dosen Anggota Ka Prodi

Rodiyati Azrianingsih

Rodiyati Azrianingsih, Suharjono, Nia Kurniawan, Irfan Mustafa, Yoga Dwi Jatmiko, Jati Batoro, Amin Setyo Leksono

Dian Siswanto, S.Si., M.Si., M.Sc., Ph.D

Capaian Pembelajaran

CPL PRODI

PLO 2. Memahami prinsip keilmuan biologi secara komprehensif dan ilmu-ilmu dasar pendukungnya, serta mengikuti perkembangan biologi moderen. (H)

PLO 3. Memahami metodologi dalam ilmu biologi dan penerapannya dalam perspektif biokonservasi. (M)

PLO 5. Terampil memecahkan masalah sesuai metode ilmiah dengan menerapkan pengetahuan biologi, metode analisis biologi, penerapan teknologi (L)

CP – MK

CLO.1. Memahami prinsip dan konsep biosistematika dan peran pentingnya dalam bidang biologi.

CLO.2. Menjelaskan penerapan kajian biosistematik dalam pemecahan masalah biologi dalam perspektif biokonservasi.

CLO.3. Menyelesaikan tugas dalam menyusun komponen biosistematika, serta menyampaikan interpretasinya dengan baik.

Deskripsi Singkat MK

Mata kuliah Biosistematika merupakan mata kuliah wajib dengan bobot 2 sks. Mata kuliah ini terintegrasi bersamaan waktu pengambilannya dengan Diversitas Flora dan Diversitas Fauna. Biosistematika mempelajari sistem penggolongan makhluk hidup yang mengindahkan kekerabatannya secara evolusioner, melalui analisis filogenetik dan fenetik. Materi yang diberikan mencakup dua fokus, yaitu materi (1) membahas prinsip biosistematika dan peran pentingnya bagi biologi dan biokonservasi, serta mempelajari

komponen taksonomi dan evolusi makhluk hidup yang mendasari kajian biosistematika, meliputi deskripsi, identifikasi, klasifikasi, nomenklatur, variasi, spesiesi dan filogeni. Materi (2) membekali keterampilan untuk mengonstruksi pohon filogeni (dendrogram dan kladogram) dan menganalisisnya.

Materi Pembelajaran / Pokok Bahasan

1. Pengertian Biosistematika (perbedaan dan interseksi dengan Taksonomi) 2. Prinsip Biosistematika, kedudukan dan peranannya pada kajian biologi. 3. Evolusi makhluk hidup, terjadinya Variasi & Spesiesi, dan aspek Filogeografi. 4. Evolusi Evidences sebagai Taxonomical markers dan sumber rujukannya (pustaka, institusi dan metode yang relevan) 5. Metode dokumentasi sampel takson/organisme yang relevan bagi studi biosistematika (a.l. herbarium, gene-bank dll.) 6. Komponen-komponen Biosistematika: (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur), dan Filogeni), dan

penerapannya pada taksa makhluk hidup. 7. Konsep Filogeni dan model-model pendekatan/kajian-nya 8. Interpretasi pohon filogeni dan perkembangan terkini 9. Konstruksi Pohon Filogeni (manual dan elektronik): dendrogram dan kladogram 10. Analisis dan Review

Media Pembelajaran

Tatap muka Perangkat Keras : Buku-buku referensi, LCD, Laptop, alat/bahan peraga

Non-tatap muka (komunikasi online): Edmodo, Gclass

Perangkat Lunak: software konstruksi pohon filogeni, e-books, e-journal

Team Teaching 1. Rodiyati Azrianingsih, S.Si., M.Sc., Ph.D. (RA) 2. Suharjono, Drs., M.S., Dr. (SH) 3. Nia Kurniawan, S.Si., M.P., Ph.D. (NK) 4. Irfan Mustafa, S.Si., M.Si., Ph.D. (IM) 5. Yoga Dwi Jatmiko, S.Si., M.App.Sc., Ph.D. (YDJ) 6. Jati Batoro, Drs., M.Si., Dr. (JB) 7. Amin Setyo Leksono, S.Si., M.Si., Ph.D., Prof. (ASL)

Mata Kuliah Syarat

-

Minggu ke-

Sub-CP-MK (sebagai kemampuan

akhir yang diharapkan) Indikator

Kriteria & Bentuk

Penilaian

Metode Pembelajaran (Kuliah / Tugas /

bentuk pembelajaran lain)

Dursi Waktu

(menit)

Materi Pembelajaran / Bahan Kajian [Pustaka]

Bobot Penilaian

(%)

1 LLO.1. Memahami tujuan, referensi (sumber pustaka acuan), kegiatan perkuliahan yang terintegrasi dengan praktikum, serta menyepakati kontrak perkuliahan. LLO.2. Memahami arti Biosistematika dan mampu membandingkannya dengan taksonomi.

1. Menepati komitmen perkuliahan. 2. Mampu menjelaskan arti biosistematika dan membandingkannya dengan taksonomi.

Observasi, tes lisan dan tulisan

Kuliah, diskusi, tugas. TM: 100, BM: 120, BT: 120.

1. Pendahuluan (Metode Pembelajaran dan Kontrak Perkuliahan)

2. Arti Biosistematika vs Taksonomi (Radford, Singh)

5

2 LLO.3. Memahami prinsip Biosistematika dan ruang lingkup kajiannya. LLO.4. Memahami kedudukan dan peran Biosistematika dalam kajian biologi.

1. Mampu menjelaskan prinsip biosistematika. 2. Mampu memberikan contoh beberapa bidang ilmu yang melingkupi kajian biosistematika. 3. Mampu memberikan contoh dan penjelasan kedudukan dan peran biosistematika dalam kajian biologi.

Observasi, tes lisan dan tulisan.

Kuliah, diskusi, tugas. TM: 100, BM: 120, BT: 120.

1. Prinsip Biosistematika 2. Ruang Lingkup

Biosistematika 3. Biosistematika sebagai

tulang punggung Biologi. 4. Biosistematika

mendukung konservasi biologi.

(Radford, Stace)

5

3 LLO.5. Mampu menjelaskan evolusi makhluk hidup dan hubunganya dengan aspek filogeografi dan

1. Mampu menguraikan sejarah terbentuknya keragaman makhluk hidup yang terhubung dengan

Observasi, tes lisan dan tulisan.

Kuliah, diskusi, tugas. TM: 100, BM: 120, BT: 120.

1. Evolusi makhluk hidup. 2. Konsep diversitas: istilah

variasi dan terjadinya spesiasi (unit takson terkecil).

10

Minggu ke-

Sub-CP-MK (sebagai kemampuan

akhir yang diharapkan) Indikator

Kriteria & Bentuk

Penilaian

Metode Pembelajaran (Kuliah / Tugas /

bentuk pembelajaran lain)

Dursi Waktu

(menit)

Materi Pembelajaran / Bahan Kajian [Pustaka]

Bobot Penilaian

(%)

terjadinya diversifikasi makhluk hidup. LLO.6. Memahami konsep diversitas, variasi dan terjadinya spesiesi. LLO.7. Memahami pentingnya kajian biosistematika utk studi keragaman makhluk hidup.

filogeografi dan faktor yang mempengaruhinya. 2. Mampu menjelaskan konsep diversitas, variasi dan spesiesi. 3. Mampu memberikan contoh pentingnya kajian biosistematika utk studi keragaman makhluk hidup.

3. Filogeografi. 4. Biosistematika untuk

studi keragaman makhluk hidup.

(Radford, Mayr, Mayr, Futuyma, Darwin)

4 LLO.8. Memahami Evolusi Evidences sebagai Taxonomical markers dan sumber rujukannya. LLO.9. Mengetahui macam-macam Taxonomical markers

1. Mampu memberikan contoh-contoh Evolusi Evidences sebagai Taxonomical markers dan sumber rujukannya. 2. Mampu menyebutkan Taxonomical markers yang relevan dalam kajian suatu takson.

Observasi,tes lisan dan tulisan

Kuliah, studi referensi, diskusi dan tugas,

TM: 100, BM: 120, BT: 120.

1. Evolusi Evidences sebagai Taxonomical markers (character dan character state) dan sumber rujukannya (pustaka dan institusi).

2. Taxonomical markers (a.l. morfologi, anatomi, kimia, sitologi, DNA/RNA dll.)

(Simpson, Mayr)

10

5 LLO.10. Mengetahui metode yang relevan untuk dokumentasi sampel takson/organisme bagi studi biosistematika

1. Mampu menjelaskan metode yang sesuai untuk mendokumentasikan spesimen. 2. Mampu menguraikan tahap-tahap dalam metode dokumentasi.

Observasi, penugasan, tes tulis/lisan.

Kuliah, studi referensi, praktek

TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Metode dokumentasi sampel takson/organisme yang relevan bagi studi biosistematika (a.l. herbarium, gene-bank dll.) (Vogel, Radford, Tjitrosoepomo)

10

Minggu ke-

Sub-CP-MK (sebagai kemampuan

akhir yang diharapkan) Indikator

Kriteria & Bentuk

Penilaian

Metode Pembelajaran (Kuliah / Tugas /

bentuk pembelajaran lain)

Dursi Waktu

(menit)

Materi Pembelajaran / Bahan Kajian [Pustaka]

Bobot Penilaian

(%)

6 LLO.11. Memahami Konsep Filogeni dan model-model pendekatan/kajian-nya

1. Mampu menjelaskan Konsep Filogeni dan model-model pendekatan/kajian-nya (a.l. fenetik dan filogenetik).

2. Mampu mengenali kelebihan dan kekurangan dari masing-masing pendekatan tersebut.

Observasi, tes tulis/lisan

Kuliah dan diskusi TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Konsep Filogeni dan model-model pendekatan/kajian-nya (Radford, Simpson)

5

7 LLO.12. Mampu menginterpretasi pohon filogeni sesuai perkembangan terkini

Mampu menjelaskan makna dari suatu pohon filogeni terkait perkembangan dan pemanfaatan suatu takson.

Observasi, tes tulis/lisan

Kuliah dan diskusi TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Interpretasi pohon filogeni dan overview perkembangan terkini bagi peningkatan nilai manfaat suatu takson. (Radford, Simpson)

5

8 Comprehensive Asessment terhadap ketercapaian LLO.1 sampai LLO.12. dan CLO 1 dan CLO 2.

Ujian tulis 120 UTS

9 LLO.13. Memahami Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni yang spesifik

1. Mampu menjelaskan struktur dari deskripsi pada masing-masing kelompok takson.

Observasi, tes tulis/lisan, penugasan

Kuliah dan diskusi TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Monera dan Protista

7,5

Minggu ke-

Sub-CP-MK (sebagai kemampuan

akhir yang diharapkan) Indikator

Kriteria & Bentuk

Penilaian

Metode Pembelajaran (Kuliah / Tugas /

bentuk pembelajaran lain)

Dursi Waktu

(menit)

Materi Pembelajaran / Bahan Kajian [Pustaka]

Bobot Penilaian

(%)

pada masing-masing kelompok makhluk hidup

2. Mampu menjelaskan perkembangan klasifikasi pada masing-masing kelompok takson.

3. Mampu menjelaskan cara mengidentifikasi suatu takson.

4. Mampu menjelaskan kaidah nomenklatur.

5. Mampu menjelaskan pohon filogeni umum/sederhana dari suatu takson contoh setiap kingdom.

(Marguilis, Vos)

10 TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Fungi dan Tumbuhan. (Marguilis, Simpson, Singh, Stace, Judd)

7,5

11 TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Hewan. (Marguilis, Mayr, Mayr)

7,5

12 LLO.14. Mampu mengonstruksi dendrogram dan kladogram. LLO.15. Mampu menginterpretasikan pohon filogeni.

1. Mampu mengenali karakter yang primitive dan modern.

2. Mampu menyusun table takson vs karakter

Observasi, penugasan

Latihan berbasis PBL TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi manual): Pemilihan characters-character states, tabel takson vs karakter. (Radford, Simpson)

27,5

13 Mampu membuat dendrogram baik secara manual maupun elektronik, dan

Observasi, penugasan

Latihan berbasis PBL TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi manual dan elektronik): Jarak

Minggu ke-

Sub-CP-MK (sebagai kemampuan

akhir yang diharapkan) Indikator

Kriteria & Bentuk

Penilaian

Metode Pembelajaran (Kuliah / Tugas /

bentuk pembelajaran lain)

Dursi Waktu

(menit)

Materi Pembelajaran / Bahan Kajian [Pustaka]

Bobot Penilaian

(%)

menentukan jarak evolusinya.

evolusi, pembuatan pohon (dendrogram). (Radford, Simpson)

14 1. Mampu mengakses dan menggunakan data dari gene-bank.

2. Mampu mengonstruksi kladogram dengan menggunakan software.

Observasi, penugasan

Latihan berbasis PBL TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi elektronik):manajing data gene-bank, pembuatan pohon (kladogram). (Radford, Simpson, Judd)

15 Mampu menginterpretasikan pohon filogeni dan mengaitkannya dengan berbagai pemanfaatannya bagi kajian biologi aplikasi (a.l. pemuliaan, konservasi dll.)

Observasi, penugasan

Latihan berbasis PBL TM: 100, BM: 120, BT: 120.

Analisis pohon filogeni (dendrogram vs kladogram) dan Diskusi & Review (Pustaka terkini yang relevan)

16 Comprehensive assessment terhadap ketercapaian LLO.13 - LLO.15.

Mengumpulkan tugas mini-project TM: 100, BM: 120, BT: 120.

UAS

Sumber Pustaka Darwin, C. 1859. On the origin of species. W. Clowes and Sons. London UK Judd,W. S., C. S. Campbell, E. A. Kellog, P. F. Stevens, & M. J. Donoghue. 2002. Plant Systematics A Phylogenetic Approach Second Edition. Sinauer Associates. Sunderland. Futuyma, D.J. 2005. Evolution. Sinauer Associates, Inc. Publisher. Sunderland USA Margulis, L. and Schwartz, K.V. 1998. Five Kingdoms, an Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth. 3rd edition. A.W.H. Freeman/Owl Book. New York. Mayr, E. 2001. What Evolution Is. Orion Books Ltd. London England

Mayr, G. 2009. Paleogene Fossil Bird. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. Heidelberg Germany Radford, A.E. 1986. Fundamentals of Plant Systematics. Harper & Row Publisher. NY; Simpson, M.G. 2006. Plant Systematics. Elsevier. UK Singh, G. 2003. Plant Systematics: An Integrated Approach. Science Publishers. London; Stace, C.A. 1979. Plant Taxonomy and Biosystematics. Edward Arnold a Division Holder a Stoughton. London; Tjitrosoepomo, G. 2005. Taksonomi Tumbuhan. Gajah Mada University Press. Yogyakarta. Vogel, E.V. 1987. Manual of Herbarium Taxonomy: Theory and Practice. Rijkherbarium. Leiden. Vos, P.D. et.al. 2009. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology Second Edition Volume Three The Firmicutes. Springer. USA

JADWAL KULIAH BIOSISTEMATIKA

HARI : SENIN 07.30-9.15 (Kelas A) / 09.20-11.05 (Kelas B) / 13.00-14.45 (Kelas C)

TEMPAT : MP 2.4

No Tanggal Topik Metode Pembelajaran Dosen Kelas

A B C

1 27-01-2020 1. Pendahuluan (Metode Pembelajaran dan Kontrak

Perkuliahan) 2. Arti Biosistematika vs Taksonomi

Ceramah, diskusi, tugas RA RA RA

2 03-02-2020

1. Prinsip Biosistematika 2. Ruang Lingkup Biosistematika 3. Biosistematika sebagai tulang punggung Biologi. 4. Biosistematika mendukung konservasi biologi.

Ceramah, diskusi, tugas RA RA RA

3 10-02-2020

1. Evolusi makhluk hidup. 2. Konsep diversitas: istilah variasi dan terjadinya

spesiasi (unit takson terkecil). 3. Filogeografi. 4. Biosistematika untuk studi keragaman makhluk hidup.

Ceramah, diskusi, tugas NK ASL JB

4 17-02-2020

1. Evolusi Evidences sebagai Taxonomical markers (character dan character state) dan sumber rujukannya (pustaka dan institusi).

2. Taxonomical markers (a.l. morfologi, anatomi, kimia,

sitologi, DNA/RNA dll.)

Ceramah, studi referensi, diskusi, tugas

NK ASL JB

5 24-02-2020 Metode dokumentasi sampel takson/organisme yang relevan bagi studi biosistematika (a.l. herbarium, gene-

bank dll.)

Ceramah, studi referensi praktek

NK ASL JB

6 02-03-2020 Konsep Filogeni dan model-model pendekatan/kajian-nya Ceramah dan diskusi SH RA JB

7 09-03-2020 Interpretasi pohon filogeni dan overview perkembangan terkini bagi peningkatan nilai manfaat suatu takson.

Ceramah dan diskusi SH RA JB

8 Sesuai Jadwal

UTS Comprehensive Asessment terhadap ketercapaian LLO.1 sampai LLO.12. dan

CLO 1 dan CLO 2. Tim

9 30-03-2020

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Monera dan Protista

Ceramah dan diskusi SH IM YDJ

10 06-04-2020

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Fungi dan Tumbuhan.

Ceramah dan diskusi RA RA JB

11 13-04-2020

Penerapan komponen Biosistematika (Deskripsi, Klasifikasi, Identifikasi, Tata nama (nomenklatur) dan Filogeni) pada Kingdom Hewan.

Ceramah dan diskusi NK ASL YDJ

12 20-04-2020

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi manual): Pemilihan characters-character states, tabel takson vs

karakter.

(Radford, Simpson)

Latihan berbasis PBL RA IM RA

13 27-04-2020

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi manual dan elektronik): Jarak evolusi, pembuatan pohon (dendrogram).

(Radford, Simpson)

Latihan berbasis PBL RA IM RA

14 04-05-2020

Dasar konstruksi pohon filogeni (aplikasi elektronik):manajing data gene-bank, pembuatan pohon (kladogram).

Latihan berbasis PBL SH IM YDJ

15 11-05-2020

Analisis pohon filogeni (dendrogram vs kladogram) dan Diskusi & Review

Latihan berbasis PBL SH IM YDJ

16 Sesuai jadwal

UAS Comprehensive assessment terhadap ketercapaian LLO.13 - LLO.15 Tim

Penilaian (assessment) Aspek Penilaian Unsur Penilaian Persentase (%)

Penguasaan materi

Tugas terstruktur/kuis 15

Keaktifan mengerjakan latihan 15

Ujian Tengah Semester 35

Ujian Akhir Semester 35

Total 100