i

PROSIDING

KONSER KARYA ILMIAH

ISSN 2460 - 5506

TINGKAT NASIONAL TAHUN 2018

” Peluang dan Tantangan Pembangunan Pertanian Berkelanjutan di Era Global dan Digital”

Reviewer:

Prof. Dr. Ir. Didik Indradewa, Dip.Agr.St.

Guru Besar di Bidang Ilmu Fisiologi Tanaman

Universitas Gajah Mada

Prof. Dr. Ir. Sony Heru Priyanto, MM

Guru Besar di Bidang Ilmu Management Kewirausahaan Universitas Kristen Satya Wacana

Prof. Dr. Ir. Eko Sediyono, MKom.

Guru Besar di Bidang Ilmu Komputer

Universitas Kristen Satya Wacana

KAMIS, 13 SEPTEMBER 2018

FAKULTAS PERTANIAN DAN BISNIS

UNIVERSITAS KRISTEN SATYAWACANA

SALATIGA

2018

Kata Pengantar

Aktivitas akademik dalam menghidupkan tradisi kecendiakawanan di kalangan kampus,

baik dosen maupun mahasiswa menjadi sebuah keniscayaan dan kebutuhan esensial; terutama

berkenaan dengan upaya peningkatan kapasitas intelektual dan kematangan kepribadian serta untuk

menghidupkan suasana akademik di kalangan komunitas Pendidikan Tinggi. Aktivitas yang berupa

penelitian (riset) dan publikasi; pendidikan dan pengajaran; dan pengabdian masyarakat

merupakan hakikat, eksistensi, serta bagian yang integral dari berdirinya Pendidikan

Tinggi. Salah satu bentuk nyata dari pengkomunikasian hasil riset oleh Fakultas Pertanian dan

Bisnis adalah melalui kegiatan Seminar Nasional, namun kami memakai istilah Konser Karya Ilmiah

Nasional (KKIN) karena kami mengambil konsep sebuah bentuk pertunjukkan atau pameran atau

pemaparan hasil-hasil penelitian para dosen, mahasiswa, peneliti, dan praktisi secara langsung akan

direview, didiskusikan, serta dinilai oleh para reviewer. Dalam pertunjukkan inilah diharapkan terjadi

komunikasi-komunikasi yang intensif yang bermuara pada publikasi dan desiminasi hasil yang dapat

dimanfaatkan oleh para akademisi maupun masyarakat luas. Kegiatan ini diselenggarakan pada

tingkat Nasional sehingga terbuka untuk para dosen, mahasiswa, peneliti dan praktisi dari seluruh

Indonesia.

Output/ luaran dari kegiatan ini berupa karya ilmiah (scientific paper) dalam KKIN

ini adalah naskah/laporan tertulis yang diterbitkan dalam bentuk prosiding “Konser Karya

Ilmiah” ber-ISSN yang memaparkan hasil penelitian atau pengkajian yang telah dilakukan

oleh seseorang atau sebuah tim dengan memenuhi kaidah dan etika keilmuan yang

dikukuhkan dan ditaati oleh masyarakat keilmuan. Diselenggarakannya kegiatan KKIN Tahun

2018 ini juga merupakan bentuk pertanggungjawaban akademik dari para peneliti kepada pihak

yang telah mendanai serta memenuhi kewajiban untuk diseminasi dan publikasi hasil penelitian. Dengan

forum yang diselenggarakan ini, setiap dosen, mahasiswa, peneliti serta praktisi diharapkan dapat

memiliki kesempatan untuk mengkomunikasikan dan mempublikasikan hasil penelitian maupun kajian

pustaka yang telah dilakukan.

Salatiga, 13 September 2018

Salam,

Andree Wijaya Setiawan, MP.

iii

Daftar Isi

Pengantar

Perancangan Konstruk Vektor Crispr-Cas9 Untuk Perakitan Tanaman Padi Resisten Penyakit Bacterial Leaf Blight Ivan Tjahja Pranata

Tracing Austronesian Population Migration Using Haplogroup B4a1a*Analysis Of Mitochondrial Genome Lois Bunga Lestari

Karakteristik Agronomi Dan Kandungan Artemisinin Pada 9 Genotip Artemisia cina Poliploid Hasil Induksi Colchicine Maria Marina Herawati, Endang Pudjihartati, Theresa Dwi Kurnia

Pemanfaatan Tepung Daging Buah Kluwak (Pangium edule Reinw.) Dalam Pembuatan Danish Pastry Mayer Tinting Sirenden, Marthina Meylani Seylatuw, Maria Kristina Anggraeni, Monika Rahardjo

Peningkatan Kesejahteraan Kelompok Wanita Tani Desa Wiladeg Karangmojo Gunung Kidul Melalui Produk Olahan Tanaman Lidah Buaya Maria Theresia Darini, Susi Widiatmi, Wahyu Setyo Ratri

PPPE Komoditas Kopi di Kabupaten Temanggung Provinsi Jawa Tengah Suprihadi, Suharyadi, Agus Bambang Nugraha

Pertumbuhan Dan Hasil Tanaman Padi Yang Ditanam Berdasarkan Pranata Mangsa Dengan Sistem Jajar Legowo 6:1 Dan 2:1 Luciana Elyanesa, Yohanes Hendro Agus

Strategi Komersialisasi Hasil Riset Ubi Kayu Isnani Subekti, Nurul Khumaida, Sintho Wahyuning Ardie

Efektifitas Ekstrak Tuba (Derris eliptica Roxb.) dan (Blumea balsamifera (L.) DC.) Terhadap Aktivitas Makan Siput Murbey Adi Oksifa Rahma Harti

Pengaruh Lama Pemeraman Terhadap Mutu Fisik, Mutu Fisiologi, Dan Mutu Biokimia Kecambah Kedelai (Glycine max [L.] Merill) Varietas Argomulyo Dan Dena 1 Yang Telah Mengalami Kemunduran Yoan Erivan, Endang Pudjihartati

Pemberdayaan Kelompok Wanita Tani (KWT) Melalui Kegiatan Pemberian Nilai Tambah Olahan Jagung (Zea mays L.) (Suatu Kasus Pada Kelompok Wanita Tani Cipta Lestari Di Desa Haurgeulis Kecamatan Bantarujeg Kabupaten Majalengka) Sri Umyati

Kemajuan Genetik Harapan Dan Daya Hasil Tiga Kultivar Kedelai Dengan Pemanfaatan Pupuk Hayati Pada Kondisi Jenuh Air Acep Atma Wijaya, Isse Tri Amelia Maksudin

Produktifitas Tanaman Kedelai (Glycine max L. Merrill) Dengan Pemberian Pupuk Hayati Fungi Mikoriza Arbuskular Miftah Dieni Sukmasari, Indra Herdian

v

Usaha Pembesaran Itik Pedaging Skala Kecil Rumah Tangga Dewi Hastuti, Endah Subekti

Kearifan Lokal Sebagai Upaya Peningkatan Produktivitas Tanah Dan Tanaman Antonius Kasno

Performa Bibit Sawi Pakcoy (Brassica rapa L.) Pada Berbagai Nilai EC (Electrical Conductivity) Dengan Metode Hidroponik Imam Ifanto

Pengaruh Aplikasi Asam Humat Terhadap Peningkatan Produktivitas Hasil Jagung Pada Tanah Inceptisol Tia Rostaman, Antonius Kasno

Karakter Tujuh Varietas Cabai Merah Keriting Pada Fase Pembibitan Dan Potensi Hasil Produksi Buah Cabai Ahmad Fatkul Khoir

Analisis Fisik-Biofisik, Sosial-Budaya Dan Estetika Lanskap Untuk Pengembangan Agrowisata Desa Tlahab Palupi Ika Wardani, Endang Pudjihartati

Respon Bibit Kelapa Sawit Terhadap Penambahan Penyinaran Dengan Berbagai Warna Lampu Serta Konsentrasi Larutan Kompos Kotoran Kambing Dalam Sistem Hidroponik

Yohana Theresia Maria Astuti, Retni Mardu Hartati, Yandri Pratama

Analisis Daya Saing Kompetitif Agrowisata Kopi Dusun Sirap, Desa Kelurahan, Kecamatan Jambu, Kabupaten Semarang Menggunakan Pendekatan Diamond Cluster Model Ambar Susiyanti, Tinjung Mary Prihtanti, Hendrik Johannes Napdapdap

Analisis Nilai Tambah Usaha Pengolahan Rajungan (Kasus Di Sentra Pengolahan Rajungan Desa Betahwalang Kecamatan Bonang Kabupaten Demak) Shofia Nur Awami, Eka Dewi Nurjayanti

Analisis Pendapatan Pada Perkebunan Rakyat Kelapa Sawit Dan Karet di Kecamatan Kampar Utara Kabupaten Kampar Dimas Deworo Puruhito, Listyani, Fitri Kurniawati

Kebutuhan Pupuk Mop Pada Tanah Inceptisols Bogor Dengan Status Hara K-Potensial Dan K Tersedia Rendah Untuk Tanaman Jagung Nurjaya, Heri Wibowo

Respon Pertumbuhan Dan Produksi Kelapa Sawit Pada Aplikasi Pupuk Pelepah Yohana Theresia Maria Astuti, Tri Nugraha Budi Santosa, Dimas Deworo Puruhita, Latif Wrestiawan, Eddy Sugiharto, Y. Sugiyanto

Efektivitas Penggunaan Pupuk Majemuk Npks Terhadap Peningkatan Produktivitas Tanaman Jagung Di Daerah Bogor Tia Rostaman, Diah Setyorini, Antonius Kasno

Penggunaan Sludge Creamer Sebagai Pupuk Organik Dalam Budidaya Sawi Pakchoy (Brassica rapa L. varietas Parachinensis) Stephanie Gloria Sebastian, Bistok Hasiholan Si manjuntak

Respon Beberapa Varietas Kedelai Pada Beberapa Macam Sumber Kalium Neny Andayani, Enny Rahayu dan Joko Tritunggal

vi

The Field Efficacy Of Bio-Chemical Pesticide Mixture For Nettle Caterpilar Pest Control On Oil Palm Plantation Samsuri Tarmadja, Boby Leonard

Respon Tanaman Cabai Terhadap Pupuk Npk Majemuk Yang Diaplikasikan Secara Langsung Melalui Tanaman Tia Rostaman, Nurjaya

Pruning Effect Of Agronomic Characters 9 Genotype Poliploid Artemisia china Omega Ria, Maria Marina Herawati

Pengaruh Suhu Dan Pengemasan Vakum Terhadap Kualitas Sayur Brokoli Selama Masa Simpan Irma Luv’yattul Hanifah, Maria Marina Herawati

Analisis Persepsi, Preferensi Dan Ekspektasi Untuk Pengembangan Welcome Area Agrowisata Salatiga Helmi Prayoga, Endang Pudjihartati

Evaluasi Kesesuaian Lahan Untuk Kedelai (Glycine max (L) Merill) di Kecamatan Karanggede, Kabupaten Boyolali Abia Sabath Fika Yoga, Bistok Hasiholan Simanjuntak

Penilaian Status Kesuburan Tanah Dan Pengelolaannya, Di Kecamatan Karanggede, Kabupaten Boyolali, Jawa Tengah Icha Agustian, Bistok Hasiholan Simanjuntak

The Effects Of Giving 2,4 Dichlorophenoxyacetate And Benziladenin On Explant Growth Of Stevia (Stevia rebaudiana Bertoni)

Andreas Petra Wibiantoro, Maria Marina Herawati

Pengaruh Pelilinan Dengan Lilin Lebah Terhadap Karakteristik Fisiologi Buah Pisang Cavendish Pada Masa Simpan Felicia Josephin Saranggi, Maria Marina Herawati

Pengaruh Penambahan Sari Buah Jeruk Siam Dalam Pemanfaatan Kacang Gude (Cajanus cajan) Sebagai Yoghurt Rut Asih Setiawati, Maria Marina Herawati

Seleksi 25 Genotif F1 Tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) Berdasarkan Potensi Hasil Dan Karakter Morfologi Buah Sri Utami Handayani, Theresa Dwi Kurnia SP

vii

PROSIDING KONSER

KARYA ILMIAH TINGKAT NASIONAL TAHUN 2018

ISSN 2460 - 5506

“ Peluang dan Tantangan Pembangunan Pertanian Berkelanjutan

di Era Global dan Digital”

Kamis, 13 September 2018 | Fakultas Pertanian & Bisnis UKSW

PENELUSURAN JEJAK MIGRASI POPULASI AUSTRONESIA

MENGGUNAKAN ANALISIS HAPLOGRUP B4A1A* DARI

GENOM MITOKONDRIA

TRACING AUSTRONESIAN POPULATION MIGRATION USING HAPLOGROUP

B4A1A* ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL GENOME

Lois Bunga Lestari

Supervised by Pradiptajati Kusuma, Ph.D. and F.X. Ivan Budiman, Ph. D.

Jurusan Biotechnologi Universitas Surya

ABSTRACT

The Austronesian speaker’s population is expanding through agricultural migration from Taiwan

(known as theory Out-of-Taiwan migration’) at ~5000ybp to Philipines, Indonesian Archipelago

till South Pacific. Adaptation of the spread of modern human form as archaeological, linguistic,

and anthropological evidence with genetics assimilating ‘Australo- Melanesia’ or the first

modern humans. Evolution studies and anthropologic tracing Austronesian speakers migration

are performed using a molecular genetic marker of mitochondrial DNA (mtDNA), i.e haplogroup

B4a1a*. Previously research has done by Soares on traces Austronesian migration and

concludes the existence of back migration from Bismarck to Indonesia and the absence of

haplogroup B4a1a1 or intermediate Polynesian motif (iPM) on Indonesian samples, although

the number of samples Indonesian is inadequate. This study was conducted to re-investigate

the history of demography, genetic diversity, and age of the haplogroup from the Austronesian-

speaking population with bigger data set. The research method is divided into haplogroup

determination, population genetic parameter estimation, network phylogenetic analysis,

tMRCA analysis, and BSP analysis, combining 469 mitochondrial whole genomes from the

population of Taiwan, Philippines, Indonesia, Papua New Guinea, Oceania, and Polynesia.

The result of this study indicate the presence of haplogroup B4a1a1 in Indonesian population,

the highest genetic diversity and the oldest age of haplogroup B4a1a* owned by Indonesian,

and there is no back migration from Oceania population. Austronesian-speaking population

in Indonesia has highest genetic variation and expands earlier than other populations.

Keywords: Austronesian, mtDNA, haplogroup of B4a1a*, back migration.

3

ABSTRAK

Populasi penutur berbahasa Austronesia berekspansi melalui migrasi agrikultural dari Taiwan (dikenal

sebagai teori ‘Out-of-Taiwan migration’) pada ±5000 tyl ke Filipina, Kepulauan Indonesia menuju

Pasifik Selatan. Adaptasi dari persebaran manusia modern berupa bukti arkeolog, bahasa, dan

antropologi dengan data genetik mengasimilasi ‘Australo-Melanesia’ atau manusia modern pertama.

Studi evolusi dan antropologi penelusuran jejak migrasi penutur Austronesia dilakukan menggunakan

marka genetika molekular DNA mitokondria (DNAmt), yaitu haplogrup B4a1a*. Penelitian

sebelumnya oleh Soares mengenai jejak migrasi Austronesia yang melalui jalur agrikultural

menyimpulkan adanya migrasi balik dari populasi Bismarck di Oseania ke populasi Indonesia dan

tidak ditemukannya haplogrup B4a1a1 atau intermediet motif Polinesia (iMP), adapun jumlah sampel

populasi Indonesia kurang memadai. Studi ini dilakukan untuk menginvestigasi kembali mengenai sejarah

demografi, diversitas genetik, dan umur haplogrup dari populasi penutur Austronesia dengan jumlah

sampel yang lebih besar. Metode penelitian yang dilakukan terbagi atas determinasi haplogrup sampel,

estimasi parameter genetik populasi, analisis Network Haplotipe haplogrup, analisis time to the Most

Recent Common Recent Ancestor (tMRCA) dan analisis bayesian skyline plot, dengan mengabungkan

469 genom mitokondria total dari populasi Taiwan, Filipina, Indonesia, Papua Nugini, Oseania, dan

Polinesia. Hasil menunjukkan adanya haplogrup B4a1a1 pada populasi Indonesia, diversitas genetik

tertinggi maupun umur haplogrup B4a1a* tertua dimiliki populasi Indonesia, dan tidak ditemukannya

migrasi balik dari populasi Oseania. Populasi penutur Austronesia di Indonesia memiliki variasi genetik

yang lebih tinggi dan berekspansi lebih dahulu dibanding populasi lainnya.

Kata kunci: Austronesia, DNAmt, haplogrup B4a1a*, migrasi balik.

ooOoo

4