pendahuluan-enzim-_-unitri-10-112

Download pendahuluan-enzim-_-unitri-10-112

Post on 17-Oct-2014

122 views

Category:

Documents

0 download

Embed Size (px)

TRANSCRIPT

PENGANTAR BIOKIMIA & ENZIM & KOENZIMDISUSUN OLEH DR. WIDODO S.,MKes1

PENGANTAR BIOKIMIABIOKIMIA MERUPAKAN ILMU YANG BERHUBUNGANDENGAN BERBAGAI MOLEKUL DIDALAM SEL ATAU ORGANISME YANG HIDUP BESERTA DENGAN REAKSI KIMIA-NYA.

BIOS CHEMIOS

HIDUP / HAYATIBIOLOGI

KIMIA ( Senyawa Kimia)KIMIA ORGANIK

ILMU KIMIA HAYATI ( BIOKIMIA )

TUJUAN ILMU BIOKIMIA : MENGURAIKAN DANMENJELASKAN SEMUA PROSES KIMIAWI PADA SEL HIDUP

MANFAAT ILMU BIOKIMIA ADALAH UNTUK KESEJAHTERAAN MANUSIA DAN PERKEMBANGAN ILMU PENGETAHUAN.

DAPAT DIKATAKAN HAMPIR SEMUA ILMU KEHIDUPANBERHUBUNGAN ERAT DENGAN BIOKIMIA.

APA SAJA YANG DIPELAJARI ?SELURUH REAKSI KIMIA YANG TERJADI DIDALAM TUBUH MANUSIA, MULAI DARI MAKANAN MASUK KEDLM. MULUT, TERBENTUKNYA ENERGI, SENYAWA PEMBANGUN,KOMPONEN SEL & JARINGAN, SENYAWA CADANGAN ..DST SAMPAI PENGOLAHAN DAN EKSKRESI LIMBAH METABOLISME

PERANAN BIOKIMIA KEDOKTERAN : DIAGNOSTIK PATOFISIOLOGI TERAPI PROGNOSA . REHABILITASI . PREVENTIF . FARMASI . PERAWATAN

ENZIMPENDAHULUAN : * KATALISATOR * BIOKATALISATOR

DEFINISI ENZIM : SUATU SENYAWA ORGANIK BERUPA PROTEIN YANG BERFUNGSI SEBAGAI

BIOKATALISATOR.

5

SIFAT-SIFAT ENZIM ; 1. ENZIM ADALAH PROTEIN ENZIM PUMYA SIFAT SEPERTI PROTEIN : KONDISI LINGKUNGAN, SUHU, Ph. kosentrasiSUBSTRAT, dsb. 2. BERFUNGSI SEBAGAI KATALIS Meningkatkan kecepatan reaksi tanpa mengubah ProduK / hasilnya, dan Enz tidak ikut bereaksi dengan Substratnya 3. BEKERJA SECARA KHUSUS / SPESIFIK Enzim hanya bekerja mengkatalisa satu reaksi / substrat tertentu. 4. DIBUTUHKAN DALAM JUMLAH SEDIKIT Reaksi enzimatik dalam metabolisme hanya memerlukan sedikit sekali enzim.

TATA NAMA & KLASIFIKASI ENZIM : Nama enzim diberi akhiran ase Berdasar nama substrat yang dikatalisa enzim tersebut, misalnya : -. Proteinase -. Lipase Menurut sistem IUB, enzim dibagi dalam 6 kelas utama, berdasarkan atas jenis reaksinya : 1. KELAS OKSIDO REDUKTASE 4. KELAS LIASE 2. KELAS TRANSFERASE 5. KELAS ISOMERASE 3. KELAS HIDROLASE 6. KELAS LIGASE

7

Menurut sistem IUB, nama enzim dapat ditulis dengan KODE ENZIM ( KODE NOMOR ENZIM ) : NAMA ENZIM TERDIRI DARI 4 ANGKA : . ANGKA PERTAMA KELAS ENZIM

. ANGKA KEDUA. ANGKA KETIGA

SUBKELASSUBSUBKELAS

. ANGKA KEEMPATCONTOH : E.C. 2.7.1.1 KELAS

NAMA SPESIFIK ENZIM

ALKOHOL FOSFAT

HEKSOKINASE

ATP : D-HEKSOSA-6 FOSFOTRANSFERASE (HEKSOKINASE ) ATP + D-HEKSOSA ADP + D-HEKSOSA-6 FOSFAT8

KELAS 1 : OKSIDO REDUKTASEYANG MENGKATALISA REAKSI OKSIDASI REDUKSI, TERMASUK TERHADAP GUGUS CH- OH, CH-CH, C=O, CH-NH2, CH=NH. SRED eS1 OKS S1 RED SOKS

CONTOH : 1.1.1.1. ALKOHOL : NAD OKSIDOREDUKTASE ( ALKOHOL DEHIDROGENASE ) ALKOHOL H+ + eNAD+ NADH + H+ ALDEHID / KETON

9

Contoh :* Subkelas 1.4 : Enz yang bekerja pada gugus CH-NH2 E.C. 1.4.1.3. =Glutamat : NAD(P) oksido reduk-tase ( deaminasi ) Glutamat + H2O NAD(P)+ e Ketoglutarat NAD(P)H + H+

Dari Subkelas 1.11. = Enz yang bekerja pada H2O2 E.C. 1.11.1.6. = H2O2 oksidoreduktase ( Katalase )

H2O2 + H2O2

2 H2O2 + O2

10

KELAS 2 : TRANSFERASE YANG MENGKATALISA PEMINDAHAN GUGUS G ( SELAIN HIDROGEN ) ANTARA SEPASANG SUBSTRAT, TERMASUK GUGUS ALDEHID, KETON, ASIL ( COOH ), ALKIL (-ROH ), GLIKOLSIL ( -RCHO ), FOSFAT, SULFATS1-G G S2 S2-G S1

CONTOH : DARI SUBKELAS 2.3.- ASIL TRANSFERASE E.C. 2.3.1.6. = KOLIN 0-ASETIL TRANSFERASE (KOLIN ASIL TRANSFERASE) : Asetil-koA Asetil-Kolin koA Kolin-SH KoA-SH CONTOH : 2.7.1.1 , ATP : D-HEKSOSA-6 FOSFOTRANSFERASE ( HEKSOKINASE ) D- HEKSOSA D- HEKSOSA-6 P 11 ATP ADP

KELAS 3 : HIDROLASEYANG MENGKATALISA PEMECAHAN SENYAWA DENGAN CARA HIDROLISIS.CONTOH : DARI SUBKELAS 3.1. H2O E.C 3.1.1.8. = ASIL KOLIN ASIL HIDROLASE ( Pseudokolin Este rase ) ASIL-KOLIN KOLIN + ASAM DARI SUBKELAS 3.2. -- ikatan Glikosidik H2O E.C. 3.2.1.23 = GALAKTOSIDASE ( GALAKTOHIDROLASE ) : D- GALAKTOSIDA ALKOHOL + D-GALAKTOSA

12

KELAS 4 : L I A S E YANG MENGKATALISA PELEPASAN GUGUS DARI SUBSTRAT, DENGAN MEKANISME BUKAN HIDROLISA, DAN MENIMBULKAN IKATAN RANGKAP. X Y -CCX-Y + -C=CCONTOH : DARI SUBKELAS 4.1. IKATAN ALDEHID / KETON E.C. 4.1.2.7. = KETOSA-1P : ALDEHIDE LIASE ( ALDOLASE ) FRUKTOSA-1,6-P2 DIHIDROKSI ASETON-P + GLISERALDEHIDE-3P

DARI SUBKELAS 4.2. : E.C. 4.2.1.1. = MALAT HIDRO LIASE ( FUMARASE ) MALAT FUMARAT + H2O13

KELAS 5 : ISOMERASEMENGKATALISA INTERKONVERSI OPTIK, GEOME TRIK ATAU POSISI. CONTOH : DARI SUBKELAS 5.1. : RASEMASE / EPIMERASE E.C. 5.1.1.1. ALANIN RASEMASE ; L-ALANIN D-ALANIN

DARI SUBKELAS 5.2. : SISTRANS ISOMERASEE.C. 5.2.1.3. = TRANSRETINEN 11 SISTRANS ISOMERASE TRANS RETINEN 11-SIS-RETINEN

14

KELAS 6 : LIGASEYANG MENGKATALISA PENGGABUNGAN 2 SENYA WA DISERTAI DENGAN PEMUTUSAN IKATAN PIRO FOSFAT DARI ATP ATAU SENYAWA FOSFAT BER ENERSI TINGGI LAINNYA.TERMASUK PEMBENTUKAN IKATAN C-O, C-S, C-N & C-C

CONTOH :

DARI SUBKELAS 6.2. : IKATAN TIOESTERE.C. 6.2.1.4. = SUKSINAT : KoA LIGASE (GDP = SUKSINAT TIOKINASE )

GTPSUKSIBAT KoA-SH

GDPSUKSINIL-KoA

DARI SUBKELAS 6.3. : IKATAN C-NE.C. 6.3.1.2. = GLUTAMAT : AMONIA LIGASE ( ATP ) (GLUTAMIN SINTETASE ) GLUTAMAT + NH3 + ATP15 GLUTAMIN + ADP + Pi

LOKASI ENZIM :SEMUA ENZIM ( = PROTEIN ) DISINTESIS DI RIBOSOM. EKSKRESI ENZIM SUDAH DALAM BENTUK AKTIP, SEBAGIAN ADA YG BELUM AKTIP = ZIMOGEN = PRO ENZIM BENTUK ZIMOGEN CONTOH PADA ENZ PENCERNAAN. LOKASI KERJA ENZIM DI DALAM SEL ORGANEL, KECUALI

BEBERAPA ENZIM, SEPERTI ENZIM PENCERNAAN,ENZIM KOAGULASI ( PEMBEKUAN ) DARAH.

16

BAGIAN AKTIF DARI MOL. ENZIM :ACTIVE SITEMENGIKAT S

CATALYTIC SITEMENGOLAH S ALLOSTERIC SITE S = SUBSTRAT

MEKANISME KERJA ENZIM :REAKSI : E + S [ ES ] E + P 1. TEORI FISHER : ( KEY & LOCK THEORY )

+E S ES E P

+17

MEKANISME KERJA ENZIM :

2. TEORI INDUKSI MODEL KOSHLAND ( INDUCE FIT THEORY ) :SEBELUM TERJADI HUBUNGAN ES , KEDUA MOLEKUL SALING MENDEKAT KARENA ADANYA GUGUS-GUGUS AKTIF ( -NH2, -PO4, -SH, -OH, -COOH, dsb ) TERJADI KONFORMASI DARI MOLEKUL E. === BENTUK MOLEKUL JADI SESUAI DAN SERASI DENGAN MOLEKUL S == = TERJADI E S COMPLEX

EP SH

S18

2. Daniel Koshland : Induced fitEEnzim substrat

SSUBSTRAT

E

S

[E-S]

S

E

S

E

S

E

S

S

E

S19

FAKTOR-2 YANG MEMPENGARUHI KECEPATAN REAKSI ENZIMATIK :

1. FAKTOR SUHU :

KECEPATAN REAKSI ENZIMATIK

to C SUHU OPTIMUM pH OPTIMUM

pH

2. FAKTOR pH : PENGARUH PERUBAHAN pH :a. pH ASAM / SANGAT ASAM atau BASA / SANGAT BASA = DENATURASI ENZIM ==== FUNGSI HILANG.

b. PERUBAHAN pH ---- PERUBAHAN MUATAN PADA GUGUS- GUGUS DARI ENZIM---- PENGARUHI KONFORMASI E S -- PENGARUHI PEMBENTUKAN E-S KOMPLEKS == KECEPATAN REAKSI BERUBAH.20

3. FAKTOR KADAR SUBSTRAT & ENZIM : KADAR S