nukleus & ribosom

27
Nukleus & Ribosom Sandra Welya (F05112005) Wahyuni (F05112025) Indah Kurnia (F05112034) Jeni Yanti (F05111021) Presentasi Oleh: Kelompok 5

Upload: sandra-welya

Post on 20-Jul-2015

121 views

Category:

Documents


7 download

TRANSCRIPT

Page 1: Nukleus & ribosom

Nukleus & Ribosom

Sandra Welya (F05112005)

Wahyuni (F05112025)

Indah Kurnia (F05112034)

Jeni Yanti (F05111021)

Presentasi Oleh: Kelompok 5

Page 2: Nukleus & ribosom

Nukleus

Nukleus merupakan organelterbesar dalam sel danmengandung DNA

Gen di dalam nukleusmenyimpan informasi yang penting untuk mensintesisprotein

Page 3: Nukleus & ribosom

• Berbentuk bulat

• Ukuran 5 µm

• Terbungkus oleh dualapis membran (luar & dalam)

• Terdapat nuclear pore complex

• Didalamnya terdapatnucleolus

• Mengandung sebagianbesar gen padakromatin.

• Nuclear laminasumber: Campbell (2010)

Page 4: Nukleus & ribosom

Nukleus memiliki perananyang sangat penting bagikehidupan sel, karenaberfungsi mengendalikanseluruh kegiatan sel, seperti:

• Mengotrol sintesa protein di dalam sitoplasma

• Sebagai template RNA

• Replikasi DNA

Nukleus terdiri atas:• Membran nukleus• Nukleolus• Nukleoplasma• Kromatin

Sumber : Campbell

Page 5: Nukleus & ribosom

Membrannukleus

nukleus tersusun atas membran luar, membran dalam dan komplex pori-pori/lubangAntara membran luar dan dalamterdapat rongga yang disebutperinuclear compartement (40 nm)

•Membran luar berhubunganlangsung dengan Ribosom dan RE

• Kompleks pori terdiri dari lubang/ pori dan annulus

• Diameter pori tersebut 80 - 90 nm

• Diameter kompleks pori 120 - 140 nm

• Annulus terdiri dari 8 membranprotein

20 - 40 nm

Sumber: Campbell

Page 7: Nukleus & ribosom

NUKLEUPLASMA- Berbentuk gel. - Nukleoplasma mengandung

berbagai substansi kimia, seperti ion-ion, protein, enzim, dan nukleotid, kromatin yang tersusun atasuntaian DNA yang terikatpada protein dasar.

Nukleoprotein* Protamin, * Histon* Non histon• Enzim nukleus

DNA polimerase, RNA polimeraseadenosin diaminase, guanase,

nukleofosforilase

Page 8: Nukleus & ribosom

• Butir2 atau benang2 halus dalam nukleus ygdapat mengikat zat warna basa = basofil.

• Benang kromatin mengerut (memendek) menyerupai benang terpilinyang disebutkromosom.

• Mitosis : kromatin kromosom

• Kromatin terdiri dari DNA dan Protein Histon, sbg teras.

Page 9: Nukleus & ribosom

RIBOSOM

• Berupa organel kecil berdiameter antara 17-20 µm yang tersusun oleh RNA ribosom dan protein.

• Tempat sel membuat atau mensintesisi protein. • Terdapat bebas di sitoplasma atau melekat pada retikulum

endoplasma, yang disebut RE kasar. Tiap ribosom terdiridari 2 sub unit yang berbeda ukuran. Dua sub unit inisaling berhubungan dalam suatu ikatan yang distabilkanoleh ion magnesum.

• Saat sintesis protein ribosom mengelompok menjadipoliribosom (polisom).

Sumber: Campbell

Page 10: Nukleus & ribosom
Page 11: Nukleus & ribosom

POLIRIBOSOM (POLISOM)Butir-butir ribosom yang tersusun berderet-deret dihubungkan oleh benang-benang halus substansi sel

Jumlah ribosom dalam poliribosom dapat memberikan informasi tentang ukuran molekul protein yang disintesis di tempat tersebut

Dalam eritroblas berkaitan dengan pembentukan hemoglobin

Page 12: Nukleus & ribosom

Berdasarkan koefisien sedimentasi dikenal tiga tiperibosom:

Tipe ribosom Koefisien sedimentasi(Svedberg)

Sel prokariot

Sel eukariot (sitosol)

Sel eukariot (organel)

kloroplast

mitokondria

70S

80S

70S

55S – 80S

Page 13: Nukleus & ribosom

RIBOSOM PROKARIOT

Monomer (70S)

Subunit kecil (30S)

Subunit besar (50S)

rRNA (16S)

rRNA (23S)

rRNA (5S)

21 protein

32 protein

Ketiga rRNA disintesis oleh gen-gen yang erat berikatan , ditranskripsi oleh RNA polimerase dengan urutan:

16 S 23 S 5 S

Operon rRNA juga mengandung gen untuk beberapa tRNA

Operon : sekelompok gen dan tempat-tempat pengenal padakromosom (DNA) yang berpartisipasi pada pengaturan transkripsi

Page 14: Nukleus & ribosom

Protein ribosom ditambahkan / berkombinasi dengan rRNA pada berbagaitahapan perakitan sub unit:

Beberapa protein ditambahkan selama transkripsi

Protein lain ditambahkan setelah transkrip primer lepasdan selama pemrosesan

Protein lain lagi ditambahkan setelah rRNA matang

Page 15: Nukleus & ribosom

BENTUK FISIK RIBOSOM PROKARIOT

Subunit 70S

Ribosom lengkap / utuh

Integritasnya tergantung konsentrasi ion Mg2+

> 2 mM

Bila konsentrasi sangat tinggi menjadi partikel 100S

Bila konsentrasi < 2 mM berubah menjadi subunit 30S dan 50S

Keutuhan partikel bergantung padakonsentrasi ion Mg2+

Page 16: Nukleus & ribosom

Subunit 50S dan 30S

Bentuk irregular

Subunit 50S berbentuk bola dengan 3 tonjolan

Subunit 30S berbentuk seperti batang, berbelah menjadi dua

Page 17: Nukleus & ribosom

Perbedaan ribosomdidasarkan:

Koefisien sedimentasi

Jumlah dan macam RNA

Jumlah protein

Eukariot Prokariot

Monomer

koefisien sedimentasi

RNA

protein

80S

4

70

70S

3

55

Sub Unit Kecil

koefisien sedimentasi

RNA yang ada

protein

40S

18S

30

30S

16S

21

Sub Unit Besar

koefisienRNA protein

60.5S

58S

60S

50S

68S

27S

Page 18: Nukleus & ribosom
Page 19: Nukleus & ribosom

Ribosom mempunyai 2 tempat berikatan:

1. P-site

(tempat P, tempat berikatan peptil-tRNA), tempat tRNA

berhubungan dengan ujung rantai polipeptida yang sedang

tumbuh

2. A-site

(tempat A, tempat berikatan aminoasil-tRNA), tempat tRNA

yang akan datang (baru) yang membawa satu asam amino

Page 20: Nukleus & ribosom

Antara subunit terdapat suatu terusan tempat menembus RNA selama translasi

Page 21: Nukleus & ribosom

Isolasi lebih susah daripada ribosom pada prokariotik

Ukuran lebih besar

Suka bergabung dengan sel bakteri

Sedimen monomer 80S

Sedimen subunit 40S dan 60S

Rat liver:

KS small subunit 36,9S

BM small subunit 1,44.106 Dalton

KS large subunit 56,3S

BM large subunit 2,9.106 Dalton

Tanaman BM : 3,9.106 Dalton

Hewan BM : 4,6.106 Dalton

Page 22: Nukleus & ribosom

MITOKONDRIAL DAN CHLOROPLAST RIBOSOME

Ribosom pada kloroplast = prokariotik

Ribosom pada mitokondria tidak sama

Sedimen ribosome chloroplast : 70S dan dapat terurai : 30S (29S - 41S) dan 50S (46S – 54S)

Sedimen Ribosom Mitokondria

Monomer Small

subunit

Large

subunit

Animal

Ascomycetes

Ciliate protozoan

Higher plant

55S – 60S

70S – 75S

80S

77S – 80S

30S – 35S

30S – 40S

55S

40S

40S – 45S

50S

55S

60S

Page 23: Nukleus & ribosom

Sintesis dan Pemrosesan rRNA Eukariot

Pada eukariot sintesis rRNA (sitosol) berlangsung di nukleolus (anak inti)

Tiga peristiwa yang merupakan ciri nukleolus:

1. Transkripsi gen-gen yang mengkode rRNA (rDNA)

2. Pemrosesan molekul pra rRNA

3. Perakitan subunit-subunit pra ribosom

Page 24: Nukleus & ribosom

RNA RIBOSOME

1. RNAs pada ribosom prokariotik

Subunit (large) 50S 5s; 23S

Subunit (small) 30S 16S

2. RNAs pada ribosom eukariotik

Subunit (large) 60S 5s; 5,8S; 28S

Subunit (small) 40S 18S

3. RNAs pada kloroplas

Subunit (large) 4,5s; 5S; 23S

Subunit (small) 16S

4. RNAs pada mitokondria

Subunit (large) 5s (tumb); 16-19S (hwn); 21-26S (lain)

Subunit (small) 12S – 13S (hewan)

14S - 18S (lain)

Page 25: Nukleus & ribosom

• Fungsi utama ribosom, mereka memainkanperan perakitan asam amino untukmembentuk protein tertentu, yang padagilirannya sangat penting untukmelaksanakan kegiatan sel. Seperti yang kitaketahui mengenai produksi protein, asamdeoksiribonukleat (DNA) pertamamenghasilkan RNA (messenger RNA ataumRNA) oleh proses transkripsi DNA, setelahitu pesan genetik dari mRNA diterjemahkanmenjadi protein selama terjemahan DNA.

Page 26: Nukleus & ribosom

Sintesis protein