kelompok 4-bd biokim

Upload: sonia-ulfah

Post on 01-Jul-2018

233 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    1/30

    Kelompok 4-BD

    Biosintesis Membran FosfolipidKarimah 1111102000033 

    Yuda Kusuma A. 1111102000045 

    Euis Chodijah 1111102000046 

    Rahma Ayunda 1111102000054 Faradila 1111102000058 

    Nurhayati Indriani 1111102000126 

    Rahmi Sertiana 1111102000085 

    Ichsana Eskha 1111102000092 

    Vina fauziah 1111102000100 M. A. W. Khairurrijal 1111102000102 

    Ana Yuliana 1111102000109 

    Andis Saputra 1111102000119 

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    2/30

    Pendahuluan

    Dalam sel, membran membentuk banyak struktur yang secara

    morfologi berbeda (organel) seperti mitokondria, retikulum

    endoplasma dan retikulum sarkoplasma, kompleks golgi,

    granula sekresi, lisosom, dan membran inti. Membran

    menyediakan tempat-tempat transduksi energi, sepertifotosintesis dan fosforilasi oksidatif.

    Kebanyakan membran disusun terutama oleh lipid dan

    protein tetapi juga mengandung karbohidrat.

    Membran adalah struktur tertutup asimetrik berbentukseperti lembaran dengan bagian dalam dan luar.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    3/30

    Molekul protein spesifik berada dalam membran, dimana

    mereka melakukan fungsi spesifik organel, sel, dan organisme.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    4/30

    Komposisi Lipid

    Lipid membran terdiri dari fosfolipid, glikolipid, dan sterol-kolesterol pada membran

    mamalia.

    Fosfolipid

    Dari 2 golongan utama fosfolipid yang terdapat

    Suatu fosfogliserida mempunyai asam-asam lemak (R1 dan R2), gliserol, dan komponen

    alkohol terfosforilasi. Pada asam fosfatidat, R3 adalah hidrogen.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    5/30

    Pada membran, fosfogliserida adalah yang lebih umum dan terdiri dari rangka gliserol d

    mana terikat 2 asam lemak dalam ikatan ester dan alkohol terfosforilasi. Bagian asam lemak biasanya merupakan molekul dengan jumlah karbon genap, paling sering 14 atau 16 karbon.

    Bagian asam lemak tidak jenuh hampir seluruhnya mempunyai konfigurasi sis. Fosfogliserid

    yang paling sederhana adalah fosfatidat, yang merupakan suatu diasilgliserol 3- fosfat, suat

    zat antara penting dalam pembentukan semua fosfolipid lain, 3-fosfat diesterkan ke alkoho

    seperti etanol-amin, kolin, serin, gliserol, atau inosetol.

    Golongan kedua fosfolipid adalah sfingomielin, yang mempunyai rangka sfingosin, bukan

    gliserol. Suatu asam lemak terikat oleh ikatan amida ke gugus amino dari sfingosin. Gugushidroksil primer dari sfingosin diesterkan membentuk fosforilkolin

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    6/30

    Glikolipid

    Glikolipid, sesuai dengan namanya, adalah lipid yang mengandung gula (sugar) seperti

    serebrosida dan gangliosida dan juga berasal dari sfingosin. Serebrosida dan gangliosida

    dibedakan dari sfingomielin oleh sifat alamiah bagian yang terikat pada gugus hidroksil

     primer dari sfingosin. Pada sfingomielin, fosforilkolin terikat pada gugus alkohol.Serebrosida mempunyai bagian heksosa tunggal, glukosa atau galaktosa, pada tempatnya.

    Gangliosida mempunyai suatu rantai bercabang sampai 7 gula yang terikat pada gugus

    alkohol primer sfingosin.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    7/30

    Sterol

    Sterol yang paling umum pada membran adalah kolesterol, yang terdapat hampir eksklusi

     pada membran plasma sel mamalia tetapi juga dapat ditemukan dalam jumlah lebih sedikitdalam mitokondria, kompleks Golgi, dan membran inti. Kolesterol biasanya lebih banyak 

    terdapat pada bagian luar membran plasma.

    Semua lipid utama pada membran adalah amfipatik dan merupakan molekul yang sangat

    mirip. Seperti dapat dilihat dari model pengisi ruang. Molekul amfipatik adalah molekul yangmempunyai bagian hidrofobik dipisahkan dari bagian molekul lainnya, ia menjadi tidak larut

    dalam air tetapi larut dalam minyak. Sebaliknya, bila bagian hidrofilik dipisahkan dari bagian

    molekul lainnya, ia menjadi tidak larut dalam minyak tetapi larut dalam air. Lipid membran

    amfipatik mempunyai gugus kepala polar (polar head group) dan ekor nonpolar (nonpolar 

    tail);

    Detergen adalah molekul amfipatik yang mempunyai arti penting dalam biokim dan rumah

    tangga. Struktur molekuler detergen menyerupai fosfolipid 

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    8/30

    Protein Membran

    • Membrane adalah struktur plastis atau lentur

    yang sangat kental.

    • Membrane melokalisir enzim, berfungsi

    sebagai elemen integral dalam penggabungan

    eksitasi-respon, dan menjadi tempat untuk

    transduksi energy, misalnya pada fotosintesis

    dan fosforilasi oksidatif.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    9/30

    Protein Membran Perifer & Integral 

    • Hampir semua protein membrane adalah bagian

    integral dari membrane, dan ternya semua yang

    telah diselediki terentang sejauh 50-10 nm

    melintasi kedua lapisan.

    • Protein integral biasanya berbentuk globuler dan

    bersifat amfipatik, terdiri dari 2 ujung hidrofilikdipisah oleh bagian hidrofobik penyelang yang

    melintasi inti hidrofobik bila miner.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    10/30

    Lipid Membran Bersifat Amfipatik 

    • Semua lipid utama pada membrane

    mengandung bagian hidrofobik dan hidrofilik

    sehingga disebut “amfipatik”.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    11/30

    Lipid Membran Membentuk

    Lapisan Ganda 

    • Seperti yang diketahui pada tahun 1925 oleh Gorter

    dan Grendel, lapisan bimolekuler, atau lapisan ganda

    lipid juga dapat memenuhi persyaratan

    termodinamik molekul amfipatik dalam lingkunganair.

    • Entropi molekul pelarut di sekitarnya meningkat saat

    molekul-molekul lipid menyatu dalam suatu lapisan

    ganda.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    12/30

    Membran yang Berbeda Memiliki

    Komposisi yang Berbeda 

    • Jumlah berbagai protein disuatu membranebervariasi mulai kurang dari selusin di reticulumsarkoplasma hingga lebih dari 100 di membraneplasma.

    • Protein adalah molekul fungsional utama membranedan membentuk enzim, pompa serta kanal,

    komponen structural, antigen (mis. Untukhistokompatibilitas), dan memiliki komplemenprotein yang berbeda, tidak ada struktur membraneyang khas.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    13/30

    Model Mosaik Cairan Struktur

    Membran 

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    14/30

    Pembentukan Membran

    • Enzim-enzim terletak pada permukaan sitoplasmik vesikelreticulum endoplasma yang dapat menyusun dirinya kedalam lapisan bimolekuler yang terdinamik stabil.

    • Vesikel lipid berpindah ke apartus Golgi, yang akan berfusi

    dengan membran plasma.• Bagian dalam vesikel sesudah fusi menjadi bagian luar

    membran plasma.

    • Asimetri transversal membran ada pada vesikel RE

    sebelum berfusi dengan membran plasma.• Protein integral & protein yang disekresi disintesis dengan

    rangkaian leader N-terminal dari 15-30 asam amino.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    15/30

    • Rangkaian leader N-terminal akan menghasilkanprotein sekresi atau protein membrane matur

    Protein mutan yang mengandung rangkaian leadertidak dimasukkan ke dalam membran. Sedangkan,protein non membrane dimasukkan kedalammembran/disekresi.

    Dua model telah diusulkan untuk menjelaskanintegrasi protein ke dalam membran yaitu hipotesissinyal dan hipotesis trigger membran.

    • Hipotesis sinyal menjelaskan bahwa protein

    dimasukkan ke dalam membran serentak dengantranslasi m RNA pada polirobosom, disebut ‘’intersikontranslasi’’ 

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    16/30

    • Ribosom yang terikat pada RE akan dilepaskan dan

    berdisosiasi ke dalam subunit masing-masing

    sesudah sintesis protein selesai.• Rangkaian leader dibelah & karbohidrat yang terikat

    sbg bagian dini sintesis protein masuk ke bagian

    dalam vesikel RE.

    • Protein yang disekresi melintasi membran bilaminer

    secara sempurna dan dieluarkan ke dalam lumen RE.

    • Protein sekresi ditemukan pada lumen aparatus

    golgi, dmn karbohidrat diubah sebelum menjadiorganel intrasel spesifik atau membran sel.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    17/30

    • Protein dipacu untuk membentuk dirinya sendiri ke

    dalam membran dengan cara yang menetapkan

    asimetri transversal yang diperlukan.

    • Sekali protein dimasukkan dan berintegrasi, bagian

    leader dibelah.protein yang tidak masuk ke jalan

    pembentukan akan disekresi.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    18/30

    Sintesis fosfolipid•

    Fosfolipid disintesis di dalam RE haluskemudian akan diangkut ke Badan Golgi dan

    kemudian ke Menbran organel atau membran

    plasma, atau disekresi dari sel melalui

    eksositosis.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    19/30

    A. Sintesis asam

    fosfatidat (PA)

    •Phosphatidic acid

    merupakan prekursor

    berbagai

    fosfatigliserida.

    •Tahapan sintesisnya

    dari gliserol fosfat dandua lemak asil KoA

    dengan PA

    ditunjukkan sebagai

    prekursortriasilgliserol.

    B Sintesis

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    20/30

    B. SintesisFosfatidiletanolamin

    (PE) dan

    Fosfatidilkolin (PC)

    1. Sintesis PE dan PC darikolin dan etanolamin

    yang sudah ada

    sebelumnya

    Jalur sintesis ini

    melibatkan fosforilasi kolin

    dan etanolamin oleh

    kinase, yang diikuti

    dengan pengubahan

    menjadi bentuk aktif, CDP-

    kolin atau CDP-

    etanolamin.

    Pada akhirnya, kolin fosfat

    atau etanolaminfosfat

    dipindahkan dari

    nukleotida ke molekul

    diasilgliserol.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    21/30

    2. Sintesis PC dari

    fosfatidilserin di

    hati

    Untuk memenuhikebutuhan PC, PS

    didekarboksilasi menjadi

    fosfatidiletanolamin (PE)

    oleh PS dekarboksilase,

    yaitu enzim yangmemerlukan fosfat

    piridoksal sebagai kofaktor.

    PE kemudian menjalani

    tiga tahap metilasi untukmenghasilkan PC. S-

    adenosilmetionin (SAM)

    merupakan donor gugus

    metil.

    C F f idil i (PS)

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    22/30

      C. Fosfatidilserin (PS)

    Sintesis Fosfatidilserin

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    23/30

     

    • Jalur utama sintesis fosfatidilserin di jaringan mamalia diakibatkan

    oleh adanya reaksi pertukaran basa, yaitu saat etnolamin dari

    fosfatidiletnolamin ditukar menjadi serin. Reaksi ini bersifatreversibel, terutama digunakan untuk menghasilkan fosfatidilserin

    yang diperlukan untuk sintesis membran.

    • Dari skema ini dapat dilihat bahwa fosfatidiletnolamin menghasilkanetnolamin. Etnolamin akan menghasilkan 3 serin melalui

    fosfatidiletnlomainserin transferase (reaksi pertukaran basa) yaitu

    NH3+, HO-CH2-CH, dan COO

    -. Selanjutnya gugus hidroksi pada serin

    akan digantikan dengan gugus fosfat menghasilkan fosfatidilserin.

    (PI)

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    24/30

      D. FOSFATIDILINOSITOL (PI)

    • Disintesis dari inositol bebas dan CDP-diasilgliserol.

    • Merupakan fosfolipid yang sering mengandung asam stearat pada karbon 1 dan

    asam arakidonat pada karbon 2 gliserol.

    • Berperan sebagai gudang penyimpanan asam arakidonat di dalam membran dan

     juga menyediakan substrat untuk sintesis prostaglandin bila dibutuhkan.

    • Fungsi :

    1. Berperan dalam penjalaran sinyal melewati membran2. Berperan dalam penambatan protein membran

    Protein-protein spesifik dapat melekat secara kovalen melalui jembatan

    karbohidrat pada PI yang terikat dengan membrane, contoh protein : alkalin

    fosfatase, asetilkolin esterase. Protein di permukaan sel juga berikatan dengan

    glikosil fosfatidilinositol (GPI). Protein-protein yang terikat dengan membran lipidmenyebabkan protein tersebut tertambat-GPI dapat bergerak dengan cepat ke sisi

    lateral di permukaan membrane plasma. Protein dapat terlepas dari penambatnya

    melalui kerja fosfolipase C dengan melepaskan diasilgliserol.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    25/30

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    26/30

    E. Fosfatidilgliserol (PG) dan kardiolipin

    • Fosfatidilgliserol berada pada membran mitokondriasebelah dalam.

    • PG merupakan prekursor kardiolipin.

    PG disintesis melalui dua tahapan reaksi dari CDP-diasilgliserol dan gliserol 3-fosfat

    • Kardiolipin terdiri atas dua molekul asam fosfatidatyang dihubungkan dengan satu molekul gliserol

    Kardiolipin disintesis melalui pemindahandiasilgliserolfosfat dari CDP-diasilgliserol ke molekulfosfatidilgliserol yang sebelumnya sudah ada.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    27/30

    F. Sfingomielin

    • Sfingomielin adalah struktur lipid utama di membrane

     jaringan saraf.• Sfingomielin menghasilkan asam lemak, asam fosfat, kolin

    dan amino alkohol kompleks yaitu sfingosin.

    • Kombinasi sfingosin dan asam lemak disebut seramida,struktur yang juga ditemukan pada glikolipid.

    • Proses sintesis sfingomielin : palmitoil KoA dipadatkandengan serin, yang merupakan koenzim A dan guguskarboksil (sebagai CO2) serin menghilang. Hasil reaksinyadireduksi dalam reaksi yang membutuhkan NADPH menjadisfinganin, yang diasetilasi pada gugus aminonya dengansalah satu dari berbagai asam lemak rantai panjang, dankemudian di desaturasi untuk menghasilkan seramida-prekursor langsung sfingomielin.

    • Sama halnya lesitin dan sefalin, senyawa ini merupakankomponen essensial dalam struktur protoplasma.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    28/30

    Degradasi fosfolipid

    •Pengertian fosfogliserida : fosfogliserida

    merupakan suatu fosfolipid yang mengandung

    gliserol.

    •Fosfolipase merupakan enzim utama dalam

    pendegradasian fosfogliserida.

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    29/30

    A. Degradasi fosfogliserida

  • 8/15/2019 Kelompok 4-BD Biokim

    30/30

    B. Degradasi sfimngomielin