dasar metabolisme sel
TRANSCRIPT
1
BIOLOGI DASARUntuk Mahasiswa Semester I
Jurusan Matematika2013/2014
Agustina Tangapo
Enzim
Kuliah Biologi Dasar I
Jurusan Matematika (2013/2014)
Dasar-dasar Metabolisme Sel
Agustina Monalisa Tangapo
Metabolisme• keseluruhan reaksi kimia yang terjadi di dalam
organisme1. Katabolisme (degradasi): penguraian molekul organik kompleks menjadi
molekul anorganik sederhana (― energi)
2. Anabolisme (biosintesis): pembentukan molekul organik kompleks dari
molekul anorganik sederhana (+ energi)
• Jumlah anabolisme dan katabolisme
Pathway: urutan tahap-tahap reaksi kimia dari prekursor (prazat) s.d. produkmelalui metabolit-metabolit
Metabolit: senyawa kimia antara yang terdapat dalam metabolisme
Jalur metabolisme yang akan bekerja dan kecepatan jalur dikontrol oleh sel dengan bantuan ENZIM (biokatalisator)
• A unique protein
• Mostly in metabolism
• Biological catalysts
Enzyme
Sifat-sifat enzim
• Enzim aktif dalam jumlah yang sangat sedikit, sbg biokatalisator, reaksinyamenjadi sangat cepat dan berulang ulang
• Enzim tidak terpengaruh oleh reaksi yang dikatalisisnya pada kondisi stabil(Enzim merupakan biokatalisator yang mempercepat jalannya reaksitanpa ikut bereaksi)
• Kerja katalis enzim spesifik, karena sisi aktif enzim setangkup denganpermukaan subtrat tertentu
• Enzim sangat peka terhadap faktor-faktor yang menyebabkan denaturasiprotein misalnya suhu, pH dll
• Enzim dapat dipacu maupun dihambat aktivitasnya
• Enzim bermolekul besar
• Logam, memacu aktifitas enzim: Mg, Mn, Co, Fe
• Logam berat, menghambat aktivitas enzim: Pb, Cu, Zn, Cd, Ag
Pengelompokan enzim
Penamaan umum: substrat (proses) + akhiran-ase
• Cofactors– Activator– Coenzymes– Prosthetic groups
Some enzymes require other molecules in order to repeat
Mekanisme reaksiModel lock & key Model induced fit
11
Enzymes have several ways of causing their substrates to enter the transition state:- Enzymes orient substrates- Enzymes induce strain in the substrate- Enzymes temporarily add chemical groups to substrates
Pengaruh pH terhadap reaksi enzimatis
Penghambatan aktifitas enzim ada dua tipe:
1. Kompetitif: zat penghambatmempunyai struktur yang miripdengan substrat sehingga dapatbergabung dengan sisi aktif enzim. Terjadi kompetisi antara substratdengan inhibitor untuk bergabungdengan sisi aktif enzim (misal feed back effect)
2. Non kompetitif: zat penghambatmenyebabkan struktur enzim rusaksehingga sisi aktifnya tidak cocok lagidengan substrat
Questions….????
Dasar-dasar Metabolisme Sel
20
Anabolisme
Katabolisme
Fotosintesis
Overall Reaction• Light reaction – Harvest
light energy
• Convert light energy to chemical energy
• Dark reactions – Expend chemical energy
• Fix Carbon (convert CO2 to organic form)
1. Reaksi terang. Energi sinar matahari
digunakan untuk oksidasi fotokimia
H2O menjadi O2. Elektron yang
dihasilkan dipakai untuk mereduksi
NADP+ menjadi NADPH.
Fotofosforilasi untuk sintesis ATP.
2. Reaksi gelap (reaksi yang tak perlu
energi cahaya). Sintesis karbohidrat
dari CO2 dan H2O dengan memakai
energi hasil reaksi terang (Siklus
Calvin).
Reaksi Terang
Reaksi gelap: 6 CO2 + 12 NADPH + 30 ATP + 12 H2O →C6H12O6 + 12 NADP+ + 30 ADP + 18 Pi + 6 H+
CO2 (sel mesofil) + ATP + H2O →CO2 (sel bundel pelepah) + AMP 2 Pi + H+
Reaksi terang
Reaksi gelap
Reaksi gelap (siklus Calvin)
Respirasi Seluler
33
Respirasi aerob
• Glikolisis
• Konversi asam piruvat menjadi asetil KoA
• Siklus Krebs
• Transfer Elektron
34
35
Respirasi anaerob
MitoKondria
Overview of aerobic respiration
43
Terima Kasih