anello viri dae

Upload: putri-suryani

Post on 02-Mar-2016

11 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

virus

TRANSCRIPT

Anelloviridae (Utik)Anelloviridae adalah DNA rantai tunggal yang menginfeksi manusia dan beberapa spesies hewan. Contoh hewan yang dikombinasikan dengan sistem genetic dari anelloviridae ini sendiri belum dikembangkan (Huang et all., 2012).

Genus yang mengambang ini Anellovirusawalnya termasuk spesies jenis TTV, satu spesies sementara,Torque teno mini virus(TTMV, awalnya adalah TLMV) dan virus hewan yamg tidak diklasifikasikan (Biagini et all., 2007). Baru-baru ini, seluruh anelloviruses pada hewan dan manusia telah ditempatkan pada susunan keluarga yang baru,Anelloviridae, yang termasuk dalam 9 genus. Anellovirus pada manusia termasuk torque teno virus (TTV), torque teno minivirus (TTMV), dan torque teno midivirus (TTMDV), yang memiliki tiga perbedaan genus (Huang et all., 2012). Anelloviridae diklasifikasikan sebagai virus vertebrata dan memiliki kapsid, bulat dan bentuknya isometric, ikosahedral simetri, diameter 19-27 nm (Wikipedia, 2014). Terdapat 9 genus pada familia anelloviridae yaitu : Alphatorquevirus, virus dari 3,1-3,9 kb sebelumnya diklasifikasikan sebagaiTorque teno virus Betatorquevirus, virus dengan genom kecil (2,7-2,9 kb) sebelumnya digambarkan sebagai Torque teno Mini virus Gammatorquevirus, virus dengan perantara (sekitar 3,2 kb) genom sebelumnya digambarkan sebagai Torque teno midi virus Deltatorquevirus, virus dari Tupaia (tikus pohon) dengan genom 2,2 kb Epsilontorquevirus, virus dari tamarin monyet dengan genom dari 3,4 kb Etatorquevirus, virus kucing dengan genom dari 2,1 kb Thetatorquevirus, virus anjing dengan genom dari 2,8 kb Zetatorquevirus, virus dari Douroucouli (burung hantu monyet) dengan genom 3,7 kb Iotatorquevirus, virus babi dengan genom dari 2,9 kb Kappatorquevirus, virus babi dengan genom dari 2,7 kb Lambdatorquevirus, virus singa laut California dengan genom dari 2,1 kb

A. Alphatorquevirus (Winda)Alphatorquevirus merupakan keluarga baru dari Anelloviridae yang baru-baru ini di temukan, termasuk dalam group II (ssDNA) didalam klasifikasi Baltimore. Ini mencakup banyak spesies, jenis virus sebelumnya dikenal sebagai Torque Teno Virus (TTV), Transfusi Menular Virus, SENV, SANBAN, dan lain-lain. Jenis-jenis spesies ada Torque Teno Virus 1-29. Alphatorquevirus menginfeksi manusia.Host alamnya adalah manusia, simpanse dan monyet afrika.Virionnya isocahedral, tidak menyelimuti, dengan diameter dari ~ 30-32 nm. Genom DNA beruntai Tunggal dengan panjang ~ 3,8 kb (Biagini., 2009).

B. BetatorquevirusBetatorquevirus merupakan keluarga baru dari Anelloviridae yang baru-baru ini di temukan, termasuk dalam group II (ssDNA) didalam klasifikasi Baltimore. Ini mencakup banyak spesies, jenis virus sebelumnya dikenal sebagai TLMV, TTV seperti Minivirus atau Torque Teno Mini virus. Genus Betatorquevirus mencakup jenis spesies Torque Teno Mini virus 1-9. Virus dengan genom kecil dengan 2,7-2,9 kb.Dari sejumlah kasus parapneumonik empyema Torque Teno Mini virus telah diisolasi. Signifikasi kilinis masih belum jelas. Host alamnya adalah manusia, simpanse dan monyet afrika (Galmes et all., 2012)

JaineGenus Gammatorquevirus, Deltatorquevirus, Epsilontorquevirus memiliki virion, genome, gene expression, dan replikasi nuklir yang sama, seperti yang tertera dibawah ini:Virion

Tidak menyelimuti,T = 1 simetri ikosahedral, dengan diameter sekitar 30-32nm.GenomeGenom ssDNA melingkardan panjang sekitar 3,8 kb.Genom direplikasi melalui intermediet ganda. Mengkodekan 4 protein:ORF1,ORF2,ORF3 danORF4.Gene expressionProtein yang diungkapkan olehsplicing alternatifpra-mRNA.Replikasi nuklir1. Virus menembus ke dalam sel inang.2. Tidak memiliki lapisan, virus genom ssDNAmenembus ke dalam inti.3. ssDNA diubah menjadi dsDNA dengan partisipasi faktor seluler.Transkripsi dsDNA menimbulkan virus mRNA.4. Virus mRNA ditranskripsi dan diterjemahkan untuk menghasilkan protein virus.5. Replikasi dapat dimediasi oleh protein, dan akan terjadi lingkaran secarabergulir untukmemproduksi genom ssDNA.6. ssDNA yang baru disintesis dapat baik:a) dikonversi ke dsDNA dan berfungsi sebagai template untuk transkripsi / replikasib) akan di encapsida oleh protein kapsid dan bentuk virion dirilis olehlisis sel.Namun, walaupun memiliki banyak persamaan, ketiga genus ini juga memiliki beberapa perbedaan, yaitu:1. Gammatorquevirus SpesiesJenis: Torsi teno midi virus 1Host AlamManusia, Simpanse, monyet Afrika.2. DeltatorquevirusSpesiesJenis: Torsi teno Tupaia virus 1Host AlamTupai tanah(Tupaia)3. EpsilontorquevirusSpesiesJenis: Torsi teno tamarin virusHost AlamTamarin

Thetatorquevirus

Non-menyelimuti,T = 1 simetri ikosahedral, dengan diameter sekitar 30-32nm.GenusThetatorquevirusJenis spesies : torque teno canis virusPerbedaan yang menonjol : genus yang mengandung virus yang ditemukan pada anjing domesticDaftar spesies yang membatasi ukuran genus : tidak disertakanDaftar spesies dalam genus Thetatorquevirus:Daftar virus lainnya yang berhubungan kemungkinan bisa menjadi anggota dari genus Thetatorquevirus tapi tidak disetujui sebagai spesies REPLIKASINUKLIR1. Virus menembus ke dalam sel inang.2. Uncoating, viral ssDNA genommenembus ke dalam inti.3. The ssDNA diubah menjadi dsDNA dengan partisipasi faktor seluler.dsDNA transkripsimenimbulkan mRNA virus.4. mRNA virus ditranskripsi dan diterjemahkan untuk menghasilkan protein virus.5. Replikasi dapat dimediasi oleh "Rep-seperti" protein, dan akan terjadi secarabergulir lingkaranmemproduksi ssDNA genom.6. Ini baru disintesis ssDNA dapat baika) dikonversi ke dsDNA dan berfungsi sebagai template untuk transkripsi / replikasib) akan encapsidated oleh protein kapsid dan bentuk virion dirilis olehlisis sel.EtatorquevirusVirion

Non-menyelimuti,T = 1 simetri ikosahedral, dengan diameter sekitar 30-32nm.GENOMEMelingkarssDNA genom(-) genom dari sekitar 3,8 kb. Genom direplikasi melalui intermediet ganda. Mungkin mengkodekan selama 4 protein:ORF1,ORF2,ORF3 danORF4.GENE EXPRESSIONProtein yang diungkapkan olehsplicing alternatifpra-mRNA.REPLIKASINUKLIR1. Virus menembus ke dalam sel inang.2. Uncoating, viral ssDNA genommenembus ke dalam inti.3. The ssDNA diubah menjadi dsDNA dengan partisipasi faktor seluler.dsDNA transkripsimenimbulkan mRNA virus.4. mRNA virus ditranskripsi dan diterjemahkan untuk menghasilkan protein virus.5. Replikasi dapat dimediasi oleh "Rep-seperti" protein, dan akan terjadi secarabergulir lingkaranmemproduksi ssDNA genom.6. Ini baru disintesis ssDNA dapat baik a) dikonversi ke dsDNA dan berfungsi sebagai template untuk transkripsi / replikasib) akan encapsidated oleh protein kapsid dan bentuk virion dirilis olehlisis sel.

Daftar pustaka

Huang, Yao-Wei et all., 2012. Rescue of a Procine Anellovirus (Torque Teno Sus Virus 2) from Cloned Genomic DNA in PigsBiagini, Philippe et all., 2007. Circular genomes related to anelloviruses identified in human and animal samples by using a combined rolling-circle amplification/sequence-independent single primer amplification approachKing, MQ. et all., 2011. Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses (Google eBook). Page : 331

Anonim, 2011, DNA Viruses Gammatorquevirus, SIB Swiss Institute of Bioinformatics http://viralzone.expasy.org/all_by_species/775.html (diakses tanggal: 22 Februari 2015).Anonim, 2011, DNA Viruses Deltatorquevirus, SIB Swiss Institute of Bioinformatics http://viralzone.expasy.org/all_by_species/776.html (diakses tanggal: 22 Februari 2015).Anonim, 2011, DNA Viruses Epsilontorquevirus, SIB Swiss Institute of Bioinformatics http://viralzone.expasy.org/all_by_species/777.html (diakses tanggal: 22 Februari 2015).