6. interaksi gen
TRANSCRIPT
6. INTERAKSI GEN6. INTERAKSI GEN
Interaksi GenInteraksi Gen• Interaksi INTRA-ALELIK : Interaksi alel-alel
pada lokus yang sama. Alel dominan menutupi pengaruh dari alel resesif, sebagian atau penuh
• Interaksi INTER-ALELIK : Interaksi alel-alel pada lokus berbeda. Gen pada satu lokus mempengaruhi ekspresi dari lokus lain atau gen pada satu lokus berinteraksi dengan gen pada lokus lain.
Interaksi Intra-alelikInteraksi Intra-alelik• Dominan Sempurna Dominan Sempurna (complete dominance)(complete dominance)
• Dominan tidak Sempurna Dominan tidak Sempurna (Incomplete (Incomplete dominance/Partial dominance)dominance/Partial dominance)
• Kodominan Kodominan (codominance)(codominance)
• Gen Letal Gen Letal (lethal gene)(lethal gene)
• Gen ganda Gen ganda (multiple alleles)(multiple alleles)
Dominan Tidak SempurnaDominan Tidak Sempurna
• Contoh : Warna bunga pukul empatP : RR x rr
Merah putihGamet : R rF1 : Rr
(Merah muda)
F2 : Rr x Rr RR 2 Rr rr 1 Merah : 2 Merah muda: 1 putih
red snapdragon crossed with white snapdragon
•F1 offspring have pink flowers•F2 generation : ¼ are red, ½ are pink, ¼ are white
Red = CR CR Pink = CRCW White = CWCW
AWARNA BUNGA ANYELIR (Dianthus caryophillus)
• Egg Plant Pigmentation
Bagaimana rasio Bagaimana rasio fenotipe F2 ?fenotipe F2 ?
KODOMINANKODOMINAN • Dua alel menghasilkan produk berbeda yang kerjanya berlainan yang dapat diketahui pada keadaan heterozigot• Contoh : warna bulu pada kuda
crcr = red hairscwcw = white hairscrcw = roan coat (mixture of both colors)
ALEL GANDA ALEL GANDA • Alel ganda ada tiga atau lebih bentuk alel dari suatu
gen pada satu lokus tertentu.• Umumnya setiap individu hanya mempunyai dua alel
untuk setiap gen. • Karena itu alel ganda hanya dapat dipelajari pada
populasi • Contoh :
– Golongan darah manusia– Sterilitas jantan pada tanaman tembakau
• ABO blood groups in humans are determined by three alleles, IA, IB, and IO (also referred to as i)
• Both the IA and IB alleles are dominant to the IO allele • The IA and IB alleles are codominant to each other
• I stands for “isoagglutinogen”, which is another word for antigen.
• Because each individual carries two alleles, there are six possible genotypes and four possible blood types
• IA IA or IAIO- type A• IB IB or IBIO- type B• IA IB - type AB• IOIO - type O
Sterilitas jantan pada tembakau
CONTOH 1 :
GENOTIPE P : S1 S2 X S1 S2
Gamet : S1 S2 S1 S2
GENOTIPE F1 : -------------
Polen S1 dan S2 tidak dapat tumbuh pada kepala putik (betina) karena memiliki alel yang sama (S2 dan S2)
Sterilitas jantan pada tembakau
CONTOH 2 :
GENOTIPE P : S1 S2 X S2 S3
Gamet : S1 S2 S2 S3
GENOTIPE F1 : S1 S3 S2 S3
Polen S2 tidak dapat tumbuh pada kepala putik (betina) karena memiliki alel yang sama (S2)
Sterilitas jantan pada tembakau
CONTOH 3 :
GENOTIPE P : S1 S2 X S3 S4
Gamet : S1 S2 S3 S4
GENOTIPE F1 : S1 S3 S2 S3
S1 S4 S2 S4
Polen S3 dan S4 dapat tumbuh pada kepala putik (betina) karena tidak memiliki alel yang sama
• Tiga atau lebih bentuk gen pada lokus tertentu, misal warna kulit bulu kelinciGenotipe : Fenotipe :C+ C+ Agouti (abu-abu liar)C+ Cch, C+ Ch, C+ Ca Agouti (abu-abu liar)Cch Cch, Cch Ch, Cch Ca ChinchillaCh Ch,Ch Ca HimalayanCa Ca Albino
• Alel ganda pada kelinci
Genotipe : Fenotipe :C+ C+ Agouti (abu-abu liar)C+ Cch, C+ Ch, C+ Ca Agouti (abu-abu liar)Cch Cch, Cch Ch, Cch Ca ChinchillaCh Ch,Ch Ca HimalayanCa Ca Albino
• Tipe liar selalu lebih dominan terhadap alel-alelnya.
P C+C+ x CaCa
F1 C+Ca
F2 1 C+C+ 2 C+Ca 1 CaCa
Fenotipe : 3 agouti : 1 albino
Gen LetalGen Letal• Alel menyebabkan tidak terbentuknya produk
sehingga mengakibatkan kematian (lethalitas)• Contoh : Defisiensi klorofil pada jagungP : Yy x YyGamet : Y, y Y, y F1 : 1YY : 2Yy : yy hijau kuning-hijau defisiensi klorofil
(albino)
Jagung albinoJagung albino
Dominant Lethal Alleles
INTERAKSI INTER-ALEL INTERAKSI INTER-ALEL (EPISTASI)(EPISTASI)
• KodominanKodominan• Epistasis DominanEpistasis Dominan• Epistasis ResesifEpistasis Resesif• Epistasis Dominan Ganda/IsoepistasiEpistasis Dominan Ganda/Isoepistasi• Epistasis Resesif gandaEpistasis Resesif ganda• Epistasis Dominan-ResesifEpistasis Dominan-Resesif• Semi epistasi/Gen ganda dengan efek kumulatif Semi epistasi/Gen ganda dengan efek kumulatif
Categories of Inheritance Paterns
KODOMINAN (9 : 3 : 3 : 1)
Epistasis Dominan (12 : 3 : 1)
Inheritance of fruit color in summer squash: two loci together control color and a dominant allele at one locus can mask the expression of the alleles at the second locus.
A-B- = whiteA-bbaaB- = yellowaabb = green
Gen A tidak aktif memberikan warna. Gen A epistasis terhadap gen B.
Therefore, if AaBb is crossed to AaBb, the F2 is as follows:
A-B- white 9/16A-bb white 3/16aaB- yellow 3/16aabb green 1/16
12/16 white
3/16 yellow1/16 green
Dominant Epistasis
台大農藝系 遺傳學 601 20000 Chapter 12 slide 30
Fig. 13.13 Dominance epistasis
台大農藝系 遺傳學 601 20000
Fig. 13.14 Dominance epistasis
aaBB (putih) x AAbb (ungu) AaBb (biru)
AaBb x AaBb A-B- biru 9/16 9/16A-bb ungu 3/16 3/16aaB- putih 3/16aabb putih 1/16 4/16
Genotype Phenotype F2 ratio Final phenotypic ratio
Epistasis Resesif (9 : 3 : 4)
Due to gene interaction, we see a 9:3:4 F2 ratio.
Contoh : Warna bunga Snapdragon
Epistasis Dominan Ganda (15 : 1)
TV
TV
Tv
Tv
tV
tV
tv
tv
TTVV TTVv TtVV TtVv
TTVv TTvv TtVv Ttvv
TtVV TtVv ttVV ttVv
TtVv Ttvv ttVv ttvv
(b) The crosses of Shull
TTVVTriangular
ttvvOvate
TtVvAll triangular
F1 (TtVv) x F1 (TtVv)
x
F1 generation
Gen T dan V epistasis terhadap gen t dan v
Epistasis Resesif Ganda (9 : 7)
9 C_P_ : 3 C_pp :3 ccP_ : 1 ccpp
purple white
Bila kedua genotipe homozigot resesif menghasilkan fenotip yg identik
台大農藝系 遺傳學 601 20000 Chapter 12 slide 35
Peter J. Russell, iGenetics: Copyright © Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings.
Fig. 13.16 Duplicate recessive epistasis: Generation of an F2 9:7 ratio for flower color
in sweet peas
Epistasis Dominan Resesif (13:3)• Gen C : penghasil warna
Gen c : mencegah warna Gen I : penghambat pembentukan warna Gen i : tidak menghambat pembentukan warna
P IICC x iiccputih putih
F1 IiCcMerah
F2 9 I-C- : 3 I-cc : 3 iiC- : 1 iicc putih : putih : 3 berwarna : putih 13 putih : 3 berwarna
GEN DUPLIKAT DENGAN EFEK KUMULATIF/SEMI EPISTASIS (9 : 6 : 1)
* Dua gen bukan alelnya bekerja saling menambah atau bersifat kumulatif untuk menimbulkan suatu karakter.
Contoh : pada Cucurbita pepo yang memiliki tiga macam bentuk buah yaitu cakram, bulat, lonjong.
P : BBLL x bbll cakram lonjong F1 : BbLl cakram F2 : 9 B-L- cakram 3 B-ll bulat 3 bbL- bulat cakram : bulat : lonjong 1 bbll lonjong 9 : 6 : 1
台大農藝系 遺傳學 601 20000 Chapter 12 slide 38
Peter J. Russell, iGenetics: Copyright © Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings.
Fig. 13.10 Generation of an F2 9:6:1 ratio for fruit shape in summer squash
Com
plem
enta
ry a
ctio
n
Dup
lica
te a
ctio
n
Epi
stas
is o
f aa
ove
r B
-
Epi
stas
is o
f A
- ov
er b
b
Generation of Epistatic Ratios
Epistatic Interaction Summary