ii

ii

iii

HALAMAN PERSETUJUAN PUBLIKASI

TUGAS AKHIR UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

Sebagai civitas akademik Universitas Sriwijaya, saya yang bertanda tangan di bawah

ini:

Nama : Frandi Wirajaya

NIM : 04111401019

Program Studi : Pendidikan Dokter

Fakultas : Kedokteran

Jenis Karya : Skripsi

Demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada

Fakultas Kedokteran Universitas Sriwijaya Hak Bebas Royalti Noneksklusif (Non-

exclusive Royalty-Free Right) atas karya ilmiah saya yang berjudul:

KEPEKAAN BAKTERI DARI KULTUR LCS TERHADAP ANTIBIOTIK DI

LABORATORIUM MIKROBIOLOGI KLINIK RSUP DR. MOHAMMAD HOESIN

PALEMBANGPERIODE JANUARI 2013-JUNI 2014

beserta perangkat yang ada (jika diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti

Noneksklusif ini, Fakultas Kedokteran Universitas Sriwijaya berhak menyimpan,

mengalih media/formatkan, mengelola dalam bentuk pangkalan data (database),

merawat, dan mempublikasikan tugas akhir saya tanpa meminta izin dari saya selama

tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak

Cipta.

Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya.

Palembang, 15, Januari 2015

Yang Menyatakan

(Frandi Wirajaya)

iv

PERNYATAAN

Saya yang bertanda tangan dibawah ini dengan in menyatakan bahwa:

1. Karya tulis saya, skripsi ini adalah asli dan belum pernah diajukan untuk

mendapatkan gelar akamdemik (sarjana, magister, dan/atau doktor), baik di

Universitas Sriwijaya maupun di perguruan tinggi lainnya.

2. Karya tulis ini murni gagasan, rumusan dan penelitian Saya sendiri, tanpa

bantuan pihak lain, kecuali araha verbal Tim Pembimbing.

3. Dalam karya tulis ini tidak terdapat karya atau pendapat yang telah ditulis atau

dipublikasikan orang lain, kecuali secara tertulis dengan dincatumkan sebagai

acuan dalam naskah dengan disebutkan nama pengarang dan dicantumkan

dalam daftar pustaka.

Pernyataan ini Saya buat dengan sesungguhnya dan apabila dikemudian hari terdapat

penyimpangan dan ketidakbenaran dalam pernyataan ini, maka saya bersedia

menerima sanksi akademik atau sanksi lainnya susai dengan norma yang berlaku di

perguruan tinggi ini.

Palembang, 15 Januari 2015

Yang membuat pernyataan

(Frandi Wirajaya)

v

ABSTRAK

KEPEKAAN BAKTERI DARI KULTUR LCS TERHADAP ANTIBIOTIK

DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI KLINIK RSUP

DR. MOHAMMAD HOESIN PALEMBANG

PERIODE JANUARI 2013-JUNI 2014

(Frandi Wirajaya, Januari 2015, 61 halaman)

Fakultas Kedokteran Universitas Sriwijaya

Latar Belakang: Liquor cerebrospinalis (LCS) adalah cairan yang terdapat dalam

rongga subaraknoid di otak dan medulla spinalis yang pemeriksaan kulturnya

merupakan gold standard untuk mendiagnosis meningitis bakterialis. Antibiotik

efektif mengobati meningitis bakterialis. Terapi antibiotik yang efektif memerlukan

pengetahuan tentang kepekaan bakteri. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui

kepekaan bakteri dari kultur LCS terhadap antibiotik.

Metode: Penelitian deskriptif observasional menggunakan data hasil kultur LCS dan

uji kepekaan antibiotik di Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUP Dr. Mohammad

Hoesin Palembang pada bulan Januari 2013-Juni 2014.

Hasil: Terdapat 103 isolat (37%) hasil kultur LCS tumbuh bakteri. Bakteri terbanyak

yang diisolasi adalah Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis,

Pseudomonas aeruginosa, Acinatobacter calcoaceticus, Enterococcus faecalis, dan

Escherichia coli. Hasil uji kepekaan antibiotik menunjukkan Staphylococcus sp.

sensitif terhadap vankomisin (88%-100%) dan amikasin (82,1%-90%) serta resistan

terhadap sefazolin dan seftizoksim (100%). Pseudomonas aeruginosa sensitif

terhadap amikasin (68,8%) dan resistan terhadap seftizoksim, sefepim, serta

ampisilin/sulbaktam (100%). Seluruh antibiotik resistan terhadap Acinatobacter

calcoaceticus, kecuali imipenem (55,6%). Escherichia coli sensitif terhadap

imipenem dan amikasin (100%) serta resistan terhadap ko-trimoksazol dan tetrasiklin

(100%). Seluruh antibiotik resistan Enterococcus faecalis, kecuali amoksisilin

klavulanat, imipenem, dan vankomisin (100%).

Simpulan: Sebagian besar bakteri dari spesimen LCS sudah menunjukkan resistansi

terhadap antibiotik yang diujikan pada penelitian ini.

Kata Kunci: kultur LCS, bakteri, kepekaan antibiotik

vi

ABSTRACT

BACTERIAL SENSITIVITY FROM CSF CULTURE TO ANTIBIOTIC

IN CLINICAL MICROBIOLOGY LABORATORY RSUP

DR. MOHAMMAD HOESIN PALEMBANG

PERIOD JANUARY 2013-JUNE 2014

(Frandi Wirajaya, January 2015, 66 pages)

Medical Faculty of Sriwijaya University

Background: Cerebrospinal fluid (CSF) was a liquid inside subarachnoid space of

the brain and spinal cord which was gold standard for bacterial meningitis diagnosis.

Antibiotic was effective to treat bacterial meningitis. Effective antibiotic therapy

required knowledge about bacterial sensitivity. This study was conducted to

determine sensitivity of bacteria from CSF culture to antibiotics.

Method: This was an observational descriptive study using data from the CSF culture

and antibiotic sensitivity test in Clinical Microbiology Laboratory Dr. Mohammad

Hoesin Palembang from January 2013-June 2014.

Results: There were 103 isolates (37%) with bacterial growth from CSF cultures.

Most bacteria isolated were Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis,

Pseudomonas aeruginosa, Acinatobacter calcoaceticus, Enterococcus faecalis and

Escherichia coli. The results of antibiotic sensitivity test showed Staphylococcus sp.

was sensitive to vancomycin (88%-100%) and amikacin (82.1%-90%) as well as

resistant to cephazolin and ceftizoxime (100%). Pseudomonas aeruginosa was

sensitive to amikacin (68.8%) and resistant to ceftizoxime, sefipim, and

ampicillin/sulbactam (100%). All antibiotics were resistant to Acinatobacter

calcoaceticus, except imipenem (55.6%). Escherichia coli was sensitive to imipenem

and amikacin (100%) as well as resistant to co-trimoksazol and tetracycline (100%).

All antibiotic were resistant Enterococcus faecalis, except amoxicillin clavulanate,

imipenem, and vancomycin (100%).

Conclusion: Most bacteria from CSF specimens showed resistency to antibiotics

tested in this study.

Keywords: CSF culture, bacteria, antibiotic sensitivity test

vii

KATA PENGANTAR

Pertama, saya ucapakan syukur dan terima kasih atas segala jalan yang

diberikan oleh allah SWT kepada saya, sehingga skripsi ini dapat diselesaikan tepat

pada waktunya. Saya tahu bahwa saya tidak akan bisa menyelesaikan skripsi ini tanpa

kehendak dari pada-Nya. Judul skripsi saya adalah Kepekaan Bakteri dari Kultur

LCS terhadap Antibiotik di Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUP dr. Mohammad

Hoesin Palembang Periode Januari 2013-Juni 2014.

Saya mengucapkan juga terima kasih kepda Dekan Fakultas Kedokteran

Universitas Sriwijaya Dr. dr. H. M. Zulkarnaen, M.Med.Sc, PKK, Pembantu Dekan I

dan Dekan III Fakultas Kedokteran Universitas Sriwijaya dr. Mutiara Budi Azhar,

SU, M.Med.Sc dan dr. Theodorus, M.Med.Sc beserta segenap dosen dan karyawan

atas segala bimbingan dan masuk-masukan selama pengerjaan karya tulis ini.

Saya mengucapkan terima kasih sebesar-besarnya kepada Pembimbing I dr.

H.K. Husni Samadin, Pembimbing II Sri Nita, S.Si, M.Si, Penguji Drs. Kusumo

Haryadi, Apt, MS, dan Penguji Etik Prof. dr. Hermansyah, SpPD-KR atas waktu dan

kesabarannya dalam membimbing saya untuk mengerjakan karya tulis ini dari awal

hingga akhirnya skripsi ini selesai dibuat. Sungguh sebuah kehormatan dan

kebanggaan untuk diri Saya mempunyai pembimbing seperti mereka.

Terima kasih juga saya ucapkan kepada dr. Ella, Buk Tita beserta Staf

Mikrobiologi yang lain serta mbak Venny Patricia, S.Pd, M.Kes yang telah

memberikan masukan dan penjelasan segala perihal yang terkait dengan subjek

penelitian saya serta waktu yang telah diluangkan beliau untuk membantu saya dalam

perekapan data di laboratorium dan perizinan penelitian.

Saya ucapkan terima kasih kepada kedua orang tua Saya, Yanto Madi dan

Parina karena terus memperhatikan Saya dan selalu memberikan dukungan dan

semangat tak henti-hentinya sehingga skripsi ini dapat terselesaikan dengan baik dan

tepat pada waktunya. Kemudian Saya juga berterima kasih kepada saudara Saya,

Ferly Yansyah berserta keluarga yang selalu memberikan semangat kepada Saya.

Saya ucapkan terima kasih juga kepada saudari Maya Rentina yang telah memberikan

masukan dan semangat dalam menyelesaikan skripsi in. Saya ucapkan juga terima

kasih kepada seluruh teman-teman seperjuang skripsi dibagian Mikrobiologi yang

selalu bekerjasama dalam melaksanakan penelitian ini. dan terakhir Saya ucapakan

terima kasih banyak kepada teman satu perjuangan, teman sejawat sepanjang hayat

PDU angkatan 2011 non reguler yang telah saling bekerja sama dan membantu dalam

melaksanakan penelitian ini.

Karya tulis ini masih banyak sekali kekuranganya dan kesalahan, oleh karena

itu kritik dan saran yang membangun sangat diharapkan untuk kemajuan

pengembangan pengetahuan kita. Semoga karya tulis ini bermanfaat banyak bagi

pembaca

Palembang, 15, Januari, 2015

viii

DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL ......................................................................................... i

LEMBAR PENGESAHAN .............................................................................. ii

LEMBAR PUBLIKASI .................................................................................... iii

LEMBAR PERNYATAAN .............................................................................. iv

ABSTRAK ......................................................................................................... v

ABSTRACT ........................................................................................................ vi

KATA PENGANTAR ....................................................................................... vii

DAFTAR ISI ...................................................................................................... viii

DAFTAR TABEL ............................................................................................. x

DAFTAR GAMBAR ......................................................................................... xi

DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xii

BAB I PENDAHULUAN. ................................................................................. 1

1.1 Latar Belakang. ....................................................................................... 1

1.2 Rumusan Masalah ................................................................................... 5

1.3 Tujuan Penelitian .................................................................................... 5

1.3.1 Tujuan Umum ................................................................................ 5

1.3.2 Tujuan Khusus ............................................................................... 5

1.4 Manfaat Penelitian .................................................................................. 5

1.4.1 Akademis ....................................................................................... 5

1.4.2 Praktis ............................................................................................ 5

BAB II TINJAUAN PUSTAKA ...................................................................... 6

2.1 Landasan Teori ........................................................................................ 6

2.1.1 Bakteri ............................................................................................ 6

2.1.1.1 Definisi ..................................................................................... 6

2.1.1.2 Klasifikasi ................................................................................ 6

2.1.1.3 Struktur .................................................................................... 8

2.1.1.4 Pertumbuhan dan Reproduksi .................................................. 9

2.1.2 Kultur LCS ..................................................................................... 11

2.1.2.1 Kepentingan Klinis .................................................................. 12

2.1.2.2 Pengumpulan dan Trasnpor Spesimen ..................................... 13

2.1.3 Antibiotik ....................................................................................... 15

2.1.3.1 Klasifikasi ................................................................................ 15

2.1.3.2 Resistensi Bakteri terhadap Antibiotik .................................... 25

2.1.3.3 Pemeriksaan Aktivitas Antimikroba In Vitro .......................... 27

ix

2.2 Kerangka Teori ....................................................................................... 33

2.3 Kerangka Konsep .................................................................................... 34

BAB III METODE PENELITIAN .................................................................. 35

3.1 Jenis Penelitian ........................................................................................ 35

3.2 Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................. 35

3.3 Populasi Penelitian .................................................................................. 35

3.3.1 Populasi Target .............................................................................. 35

3.3.2 Populasi Terjangkau ....................................................................... 35

3.4 Sampel Penelitian .................................................................................... 36

3.5 Kriteria Inklusi dan Eksklusi................................................................... 36

3.5.1 Kriteria Inklusi ............................................................................... 36

3.5.2 Kriteria Eksklusi ............................................................................ 36

3.6 Variabel Penelitian .................................................................................. 36

3.7 Definisi Operasional ............................................................................... 37

3.8 Cara Pengumpulan Data ......................................................................... 39

3.9 Cara Pengolahan dan Analisis Data ........................................................ 39

3.10 Kerangka Operasional .......................................................................... 40

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN .......................................................... 41

4.1 Hasil Penelitian ....................................................................................... 41

4.1.1 Hasil kultur spesimen LCS selama periode Januari 2013-Juni

2014 ................................................................................................ 41

4.1.2 Hasil uji kepekaan bakteri terbanyak yang diisolasi dari

spesimen LCS terhadap antibiotik selama periode Januari

2013-Juni 2014 ............................................................................... 44

4.1.2.1 Kepekaan Staphylococcus aureus Terhadap Antibiotik

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ......................... 44

4.1.2.2 Kepekaan Staphylococcus epidermidis Terhadap

Antibiotik Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ........ 47

4.1.2.3 Kepekaan Pseudomonas aeruginosa Terhadap

Antibiotik Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ........ 48

4.1.2.4 Kepekaan Acinatobacter calcoaceticus Terhadap

Antibiotik Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ........ 49

4.1.2.5 Kepekaan Enterobacter faecalis Terhadap Antibiotik

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ......................... 51

x

4.1.2.6 Kepekaan Escherichia coli Terhadap Antibiotik

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ......................... 52

4.2 Pembahasan ............................................................................................. 53

BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................ 60

5.1 Kesimpulan ............................................................................................. 60

5.2 Saran ....................................................................................................... 60

DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................ 62

LAMPIRAN

xi

DAFTAR TABEL

Tabel

1. Pemilihan Media Biakan untuk Spesimen LCS Menurut Hasil Hapusan

Gram ....................................................................................................... 11

2. Ukuran Inhibisi Antibiotik Menurut Metode Kirby-Bauer di

Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUP Dr. Mohmmad Hoesin

Palembang ............................................................................................... 32

3. Hasil Kultur Spesimen LCS Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 .. 41

4. Jenis Bakteri yang Diisolasi dari LCS Selama Perioda Januari

2013-Juni 2014 ........................................................................................ 41

5. Distribusi Bakteri Gram Positif yang Diisolasi dari Spesimen LCS

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ................................................ 42

6. Distribusi Bakteri Gram Negatif yang Diisolasi dari Spesimen LCS

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ................................................ 43

7. Hasil Uji Kepekaan Bakteri Terbanyak yang Diisolasi dari Spesimen

LCS terhadap Antibiotik Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ........ 45

Halaman

xii

Halaman

DAFTAR GAMBAR

Gambar

1. (a) Biakan Streptococcus pneumoniae pada Agar Darah (b) Biakan

Neisseria meningitidis pada Agar Darah (c) Biakan Haemophylus

influenzae pada Agar Darah dengan Guratan Staphilococcus aureus .... 12

2. Pengambilan Spesimen LCS dengan Pungsi Lumbal ............................. 13

3. Pengolahan Cairan Serebrospinal tanpa T-I Media................................. 14

4. Tahap Inokulasi Tes Kepekaan Kirby-Bauer pada Media Agar ............ 29

5. Tahap Penempelan Antibiotik dengan Menggunakan Disk Despenser

Otomatis .................................................................................................. 29

6. Tahap Penempelan Antibiotik dengan Cara Manual .............................. 30

7. Pengukuran Diameter Hambat dengan Menggunakan Satuan Milimeter 31

8. Cara alternatif pengukuran diameter zona hambat menggunakan satuan

millimeter, dengan cara mengukur jari-jari zona hambat. Digunakan

jika zona hambat antar antibiotik bertumpuk .......................................... 31

9. Bakteri Terbanyak yang Diisolasi dari Spesimen LCS ........................... 43

10. Kepekaan Staphylococcus aureus terhadap Antibiotik -laktam Selama

Periode Januari 2013-Juni 2014 .............................................................. 46

11. Kepekaan Staphylococcus epidermidis Terhadap Antibiotik

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ................................................. 47

12. Kepekaan Pseudomonas aeruginosa Terhadap Antibiotik Selama

Periode Januari 2013-Juni 2014 .............................................................. 49

13. Kepekaan Acinatobcater calcoaceticus Terhadap Antibiotik

Selama Periode Januari 2013-Juni 2014 ................................................. 50

14. Kepekaan Enterococcus faecalis Terhadap Antibiotik Selama Periode

Januari 2013-Juni 2014 ........................................................................... 51

15. Kepekaan Escherichia coli Terhadap Antibiotik Selama Periode

Januari 2013-Juni 2014 ........................................................................... 52

xiii

Halaman

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran

1. Data Sampel Penelitian ........................................................................... 70

2. Hasil Analisis Kepekaan Antibiotik Menggunakan Aplikasi WHONET

versi 5.6 ................................................................................................... 79

3. Surat Izin Penelitian ................................................................................ 82

4. Sertifikat Etik Penelitian ......................................................................... 83

5. Surat Keterangan Selesai Penelitian dari Bagian Diklit RSUP Dr.

Mohammad Hoesin Palembang .............................................................. 84

6. Surat Keterangan Selesai Penelitian dari Bagian Laboratorium

Mikrobiologi Klinik RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang ........... 85

7. Surat Persetujuan Revisi Skripsi ............................................................. 86

8. Artikel ..................................................................................................... 87

9. Biodata Penulis ....................................................................................... 97