106213118 5 6 asam amino peptida dan protein 2
TRANSCRIPT
![Page 1: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/1.jpg)
Syaharuddin KasimBagian Kimia Klinik FFUH
![Page 2: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/2.jpg)
Protein merupakan polimer yang tersusun atas beberapa peptida
Peptida merupakan polimer yang tersusun atas asam amino melalui ikatan peptida.
Monomer peptida disebut residu asam amino.
![Page 3: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/3.jpg)
Berdasarkan jumlah penyusunnya peptida terbagi:
Dipeptida 2 residu asam amino Tripeptida 3 residu asam amino Oligopeptida 4-10 residu asam amino Polipeptida >10 residu asam amino Protein terdiri dari polipeptida yang
tersusun atas 40-400 residu asam amino
![Page 4: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/10.jpg)
![Page 11: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/11.jpg)
Pembagian asam amino menurut gugus fungsinya:
1. Asam amino dengan rantai samping alkil (5)2. Asam amino dengan gugus –OH (2)3. Asam amino dengan atom S (2)4. Asam amino dengan gugus karboksilat (2)5. Asam amino dengan gugus amida (2)6. Asam amino mengandung 2 atau lebih gugus N
(2)7. Asam amino dengan cincin benzen (2)8. Heterosiklik asam amino (3)
![Page 12: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/12.jpg)
Glisin mengandung rantai samping –H Alanin mempunyai rantai samping metil Valin mempunyai rantai samping isopropil Leusin mempunyai rantai samping isobutil Isoleusin mempunyai rantai samping butil
![Page 13: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/13.jpg)
Serin merupakan alanin dengan subtitusi gugus –OH (subtituennya metanol)
Threonin mempunyai subtituen percabangan etanol
![Page 14: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/14.jpg)
Sistein adalah alanin dengan subtitusi –SH Metionin mempunyai subtituen 2-
methylthioethyl
![Page 15: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/15.jpg)
Aspartat adalah alanin dengan subtituen karboksilat (mempunyai gugus metil karboksilat)
Glutamat mempunyai gugus etil karboksilat
![Page 16: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/16.jpg)
Asparagin merupakan amida dari aspartat Glutamin merupakan amida dari glutamat
![Page 17: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/17.jpg)
Terdapat 2 basis asam amino (asam amino mengandung 2 atau lebih N)
Lisin mempunyai ε- gugus amino
Arginin mempunyai δ- gugus guanidino
Simbol ε dan δ mempermudah untuk mengingat jumlah atom C yang dimiliki oleh asam amino tersebut
![Page 18: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/18.jpg)
Fenilalanin merupakan alanin dengan subtitusi benzen (fenil)
Tirosin merupakan alanin dengan subtitusi fenol
![Page 19: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/19.jpg)
Prolin mempunyai atom nitrogen pada cincin furan dan merupakan satu-satunya asam amino yang mengandung gugus amin sekunder
Histidin merupakan alanin dengan subtitusi imidazol
Triptofan merupakan alanin dengan subtitusi indol
![Page 20: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/20.jpg)
Notasi D- dan L-asam amino berlaku seperti pada monosakarida
Proyeksi Fischer asam amino digambarkan dengan menempatkan gugus karboksilat di sebelah atas dan gugus R disebelah bawah.
Bila gugus amino (-NH3+) disebelah kanan disebut D-asam amino
Bila gugus amino (-NH3+) disebelah kiri disebut L-asam amino
![Page 21: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/22.jpg)
Ikatan peptida adalah ikatan amida yang terbentuk antar unit asam amino
Peptida dan protein digambarkan dengan gugus amino bebas (asam amino N-terminal) di sebelah kiri dan gugus karboksilat bebas (asam amino C-terminal) di ujung kanan
![Page 23: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/23.jpg)
Ikatan disulfida adalah ikatan S-S Apabila thiol teroksidasi akan menghasilkan
ikatan disulfida
Apabila ikatan disulfida direduksi menghasilkan thiol
![Page 24: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/24.jpg)
Sistein merupakan asam amino yang mengandung gugus thiol, sehingga dapat membentuk ikatan disulfida
Apabila protein mengandung 2/lebih as. amino sistein, dapat terbentuk jembatan disulfida yang merupakan ikatan kovalen
![Page 25: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/26.jpg)
Ketika asam amino saling berikatan melalui ikatan peptida terbentuk peptida
Apabila peptida yang terbentuk mengandung lebih dari 100 unit asam amino disebut protein
![Page 27: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/27.jpg)
Jaringan penunjang: kolagen, ion channel, prealbumin
Transport senyawa kimia dalam tubuh: hemoglobin
Proteksi tubuh: imunoglobulin Kontrol dan regulasi tubuh: hormon, insulin Katalisis : enzim Pergerakan: miosin Cadangan energi: protein otot
![Page 28: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/28.jpg)
![Page 29: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/29.jpg)
Struktur primer protein merupakan urutan asam amino dalam rantai peptida dan lokasi jembatan sulfida
![Page 30: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/30.jpg)
1. Pemutusan jembatan disulfida peptida/protein
2. Pemutusan ikatan peptida3. Penentuan asam amino N-terminal4. Penentuan asam amino C-terminal
![Page 31: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/31.jpg)
Menggunakan reagen pereduksi seperti 2-merkaptoetanol, yang akan teroksidasi menjadi disulfida
Gugus tiol dari asam amino direksikan dengan asam iodoasetat untuk mencegah pembentukan kembaliikatan disulfida
![Page 32: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/32.jpg)
![Page 33: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/33.jpg)
Menggunakan larutan asam (HCl 6N) Protein/peptida dilarutkan dalam 6 N HCl
dan dipanaskan 100 oC selama 24 jam
![Page 34: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/34.jpg)
Menggunakan Edman’s Reagent (fenil isotiosianat)
Reagen ini bereaksi dengan N-terminal membentuk tiazolinon
![Page 35: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/35.jpg)
Menggunakan karboksi peptidase A apabila C-terminal bukan berasal dari asam amino arginin atau lisin
Menggunakan karboksi peptidase B apabila C-terminal berasal dari asam amino arginin atau lisin
![Page 36: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/36.jpg)
α-helix β-pleated sheet
![Page 37: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/37.jpg)
Rantai peptida terikat menyerupai sekrup
Bentuk helix terbentuk dengan adanya ikatan hidrogen antara nitrogen amida dan oksigen karbonil yang diantarai oleh 3 unit asam amino
![Page 38: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/38.jpg)
Rantai polipeptida membentuk zigzag menyerupai lipatan kertas.
Terjadi apabila rantai peptida membentuk lipatan
Bentuk paralel apabila arah rantai peptida sama sedangkan antipararel apabila rantai peptida berlawanan arah
![Page 39: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/39.jpg)
Merupakan struktur tiga-dimensi
Dalam mempertahankan stabilitasnya, protein membentuk interaksi antar atom yang membentuk lipatan dan lekukan
![Page 40: 106213118 5 6 Asam Amino Peptida Dan Protein 2](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061616/55721370497959fc0b924d18/html5/thumbnails/40.jpg)
Denaturasi terjadi apabila struktur tersier protein terganggu
Faktor yang mempengaruhi:- pH- Senyawa kimia, seperti urea dan guanidin
HCl- Deterjen- Pelarut organik- Pemanasan